More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0186 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  100 
 
 		 416 aa  863    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  44.39 
 
 		 412 aa  329  7e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  45.26 
 
 		 410 aa  326  6e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.46 
 
 		 404 aa  320  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  42.96 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  38.9 
 
 		 416 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.18 
 
 		 404 aa  255  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.25 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.04 
 
 		 405 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4571  hypothetical protein  39.72 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2285  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.72 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2297  Fmu (Sun) domain protein  39.72 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000974746  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.72 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2088  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.72 
 
 		 404 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.18 
 
 		 419 aa  249  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2215  sun protein, putative  38.98 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1739  Fmu (Sun)  39.72 
 
 		 404 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33576  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.63 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2131  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.27 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.547964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  34.18 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.7 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2309  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.55 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2207  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.98 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  34.03 
 
 		 423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  33.65 
 
 		 466 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  33.33 
 
 		 447 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.12 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  36.91 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  33.58 
 
 		 420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.3 
 
 		 420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.3 
 
 		 420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  32.2 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  32.2 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  32.2 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  32.2 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  32.22 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  32.2 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  32.2 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.22 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.22 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  32.2 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  32.65 
 
 		 421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  31.94 
 
 		 420 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.23 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.5 
 
 		 470 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  32.38 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  31.68 
 
 		 419 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  34.13 
 
 		 417 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.86 
 
 		 417 aa  192  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  36.63 
 
 		 452 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.57 
 
 		 433 aa  192  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  32.98 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  32.63 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  35.02 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  33.44 
 
 		 452 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  34.44 
 
 		 455 aa  190  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  32.72 
 
 		 465 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.47 
 
 		 424 aa  190  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  33.51 
 
 		 416 aa  189  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.24 
 
 		 449 aa  189  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.33 
 
 		 437 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  33.9 
 
 		 446 aa  189  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  30.5 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.52 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.58 
 
 		 465 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  32.18 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  30.72 
 
 		 519 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.7 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  32.47 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  32.39 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.84 
 
 		 425 aa  182  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  31.84 
 
 		 425 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  32.33 
 
 		 415 aa  182  9.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  35.08 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  32.73 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  31.95 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  29.82 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  32.37 
 
 		 423 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.62 
 
 		 426 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  31.11 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.38 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  35.57 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  28.66 
 
 		 443 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  31.3 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  29.19 
 
 		 452 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.05 
 
 		 430 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.12 
 
 		 445 aa  173  5e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  34.33 
 
 		 446 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  28.73 
 
 		 449 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1415  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.2 
 
 		 453 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  30.96 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.66 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  30.96 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.05 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  37.14 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.69 
 
 		 429 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1392  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.49 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3295  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.23 
 
 		 459 aa  170  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1305  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.24 
 
 		 463 aa  170  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1086  Fmu (Sun)  31.8 
 
 		 454 aa  169  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.694942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>