More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0769 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0769  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
213 aa  429  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0861  ribulose-phosphate 3-epimerase  76.53 
 
 
213 aa  347  7e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1607  ribulose-phosphate 3-epimerase  70.42 
 
 
213 aa  300  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1028  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.79 
 
 
215 aa  297  1e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.198537  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0476  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.32 
 
 
215 aa  292  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0501  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.85 
 
 
215 aa  291  7e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1488  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.85 
 
 
215 aa  290  8e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.91 
 
 
213 aa  280  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
221 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.85 
 
 
224 aa  206  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 
226 aa  204  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.75 
 
 
218 aa  204  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3999  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 
224 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.79681 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.45 
 
 
230 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.85 
 
 
229 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0746  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.02 
 
 
228 aa  202  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3515  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
228 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.05 
 
 
224 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2492  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4787  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.750334 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53935  plastidic ribulose-phosphate 3-epimerase  44.65 
 
 
260 aa  199  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.014305  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
224 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1057  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 
223 aa  198  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0312064  normal  0.484494 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
214 aa  198  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0415  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.5 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545723  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0449  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.5 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.402606 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.76 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0446  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.5 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.338349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07910  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.76 
 
 
214 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0566  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.5 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.5 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.75 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5120  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.92 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0751  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.75 
 
 
234 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
247 aa  196  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.76 
 
 
214 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.75 
 
 
234 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.75 
 
 
236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.5 
 
 
225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
221 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.28 
 
 
238 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.24 
 
 
221 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 
235 aa  194  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
224 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.5 
 
 
225 aa  191  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.86 
 
 
239 aa  191  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 
216 aa  191  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 
218 aa  191  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase (D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase)  46.19 
 
 
217 aa  191  8e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00660357  normal  0.751371 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1507  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.82 
 
 
220 aa  191  9e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2230  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.24 
 
 
227 aa  190  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.375841  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  47.17 
 
 
265 aa  190  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.71 
 
 
220 aa  190  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0177  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
223 aa  189  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.02 
 
 
225 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.76 
 
 
221 aa  189  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.08 
 
 
225 aa  189  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.08 
 
 
236 aa  189  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3028  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 
234 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0136369  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
225 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
235 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03238  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0327  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3763  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0483274  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.34 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.57 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4690  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2472  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.78 
 
 
232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0327  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204958  normal  0.201128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3855  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004029  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3662  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383295  normal  0.0239622 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3582  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.111758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03190  hypothetical protein  44.55 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0167  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.6 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3799  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.08 
 
 
225 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0860843 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.34 
 
 
221 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.13 
 
 
223 aa  188  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
225 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.12 
 
 
224 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.34 
 
 
227 aa  188  5e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.12 
 
 
224 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2786  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
234 aa  188  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3682  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.08 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341104  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1715  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.13 
 
 
229 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0219  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
224 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3789  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.08 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.6 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
219 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.6 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>