271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1090 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1090  rhomboid family protein  100 
 
 		 184 aa  357  7e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0732  conserved hypothetical integral membrane protein, Rhomboid family  57.06 
 
 		 176 aa  184  5e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000749647  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  51.7 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  51.7 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  56 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1083  rhomboid family protein  51.14 
 
 		 172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400512  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0917  rhomboid family protein  49.71 
 
 		 177 aa  157  6e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1263  peptidase E  49.18 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  33.17 
 
 		 356 aa  77.8  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  29.23 
 
 		 396 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  29.3 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  32.55 
 
 		 245 aa  67  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  36.49 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  30.13 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  27.73 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  38.05 
 
 		 444 aa  64.3  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  43.81 
 
 		 541 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  43.81 
 
 		 547 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  31.58 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  31.58 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  34.21 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  36.51 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  30.95 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  30.53 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  31.38 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  30.53 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  42.86 
 
 		 541 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  34.27 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  31.05 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  32.8 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  32 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  29.8 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  35.25 
 
 		 486 aa  61.6  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  29.33 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  39.06 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  30.53 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  38.57 
 
 		 487 aa  61.6  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  38.57 
 
 		 487 aa  61.6  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  32.26 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  29.65 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  32.69 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  32.43 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  30.56 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  31.11 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  32.45 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  32.08 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  28.37 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  36.36 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  32.26 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  31.58 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  29.51 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  31.72 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  30.13 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  31.25 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03550  peptidase, S54 (rhomboid) family  29.61 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  29.3 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  31.71 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  32.89 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  30.5 
 
 		 310 aa  58.2  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1723  rhomboid-like protein  34.94 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351673  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  35.61 
 
 		 342 aa  58.2  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  28.06 
 
 		 362 aa  58.2  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  29.06 
 
 		 265 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0702  rhomboid family protein  29.1 
 
 		 360 aa  57.8  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  29.27 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  29.73 
 
 		 318 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  30.81 
 
 		 237 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  27.36 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  32.3 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  30.21 
 
 		 519 aa  57  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0559  S54 family peptidase  34.42 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568046  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  31.61 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  31.18 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  36.64 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  35.92 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1458  Rhomboid family protein  32.92 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  28.3 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  28.3 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  28.86 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  32 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  37.67 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0605  hypothetical protein  42.5 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00675072  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  35.25 
 
 		 523 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  37.23 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  39 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  35 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  27.56 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0937  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  32.06 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  28.71 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  30.68 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  34.95 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  33.15 
 
 		 298 aa  55.1  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  35.85 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  34.81 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  33.7 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  33.69 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1256  rhomboid family protein  31.02 
 
 		 253 aa  53.9  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391814  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  31.9 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>