78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12718 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 
203 aa  413  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  44.22 
 
 
200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.47 
 
 
204 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  29.32 
 
 
207 aa  101  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.31 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.5 
 
 
217 aa  94.7  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  27.86 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.79 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  25.93 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  25.93 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  25.93 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.1 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  25.63 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  25 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.77 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  26.9 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  25 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  24.02 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  24.02 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  24.02 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  24.02 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  24.02 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  28.12 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.73 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  23.81 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  23.81 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  23.81 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.81 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  23.81 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  23.81 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  23.81 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  23.81 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.79 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  23.81 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  26.6 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  23.91 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4154  phosphatase  27.57 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  24.12 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  28.95 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  27.55 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  27.86 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  30.69 
 
 
202 aa  61.6  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  36.05 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.94 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.57 
 
 
203 aa  58.2  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  32.94 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  23.44 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  39.53 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3477  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.76 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1958  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.24 
 
 
213 aa  52  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.118058 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  25.96 
 
 
196 aa  51.6  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  24.59 
 
 
212 aa  51.6  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.95 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  25.39 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.28 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.46 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  26.46 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  22.92 
 
 
208 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  42.31 
 
 
216 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  38.46 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.31 
 
 
232 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  29.03 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  22.75 
 
 
200 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11470  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  27.98 
 
 
230 aa  44.7  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241013  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  25 
 
 
133 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  32.18 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.93 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02292  hydrolase  30.68 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  25.26 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0606  HAD family hydrolase  21.93 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49461  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.73 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.04 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.81 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  37.7 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  26.32 
 
 
205 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2325  HAD family hydrolase  26.74 
 
 
199 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0245  HAD family hydrolase  20.77 
 
 
231 aa  41.2  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.3 
 
 
224 aa  41.2  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>