More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09438 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 292 aa  587  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3470  dihydrodipicolinate synthase  60.76 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604806  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  53.17 
 
 		 290 aa  317  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  45.1 
 
 		 297 aa  275  5e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  45.77 
 
 		 293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  42.16 
 
 		 292 aa  258  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  42.76 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  43.4 
 
 		 293 aa  237  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  45.96 
 
 		 293 aa  237  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  45.9 
 
 		 290 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  45.9 
 
 		 290 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  42.05 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 		 297 aa  232  7.000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  38.54 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  41.73 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  45.15 
 
 		 290 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  39.02 
 
 		 292 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  41.34 
 
 		 296 aa  229  6e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  43.11 
 
 		 290 aa  228  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  41.64 
 
 		 298 aa  227  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  41.05 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  38.81 
 
 		 292 aa  225  7e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  42.4 
 
 		 290 aa  225  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  39.31 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  39.01 
 
 		 291 aa  223  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  39.64 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  39.27 
 
 		 294 aa  221  9e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  41.34 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  37.63 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  42.4 
 
 		 290 aa  220  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  38.52 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  39.71 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  36.75 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  37.5 
 
 		 296 aa  216  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  36.81 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  36.52 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 292 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 		 289 aa  211  7.999999999999999e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 		 297 aa  211  9e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1369  hypothetical protein  41.03 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  40.74 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  39.44 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  39.63 
 
 		 300 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  39.63 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  39.63 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  39.63 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  39.63 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  39.63 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  39.63 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  39.63 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  37.89 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  36.11 
 
 		 293 aa  209  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  38.52 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  38.95 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  39.34 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  41.42 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  35.82 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  39.65 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  39.72 
 
 		 292 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  39.65 
 
 		 295 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  39.65 
 
 		 295 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  40.97 
 
 		 292 aa  205  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1860  dihydrodipicolinate synthase  42.65 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  38.75 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  38.25 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  34.84 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  39.1 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  38.25 
 
 		 291 aa  203  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  35.46 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  37.37 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  40.29 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  36.23 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  37.76 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  39.16 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  38.64 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  38.68 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  40.64 
 
 		 291 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  36.97 
 
 		 296 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  36.97 
 
 		 296 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 294 aa  201  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 		 319 aa  201  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 		 295 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  38.26 
 
 		 300 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  36.46 
 
 		 296 aa  201  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  38.26 
 
 		 300 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  37.96 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>