More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09101 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  39.13 
 
 		 968 aa  661    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  58.01 
 
 		 1118 aa  1342    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  57.52 
 
 		 1113 aa  1308    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  48.82 
 
 		 1031 aa  975    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  47.99 
 
 		 1024 aa  980    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  59.38 
 
 		 1130 aa  1275    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  56.93 
 
 		 1114 aa  1293    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  46.7 
 
 		 1027 aa  955    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  39.45 
 
 		 858 aa  657    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  46.73 
 
 		 1136 aa  1027    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  51.38 
 
 		 1116 aa  1146    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  47.15 
 
 		 1024 aa  978    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  48.92 
 
 		 1017 aa  971    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  42.8 
 
 		 1117 aa  811    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  70.66 
 
 		 1114 aa  1649    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  100 
 
 		 1117 aa  2298    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  59.96 
 
 		 1102 aa  1339    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  71.79 
 
 		 1120 aa  1704    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  57.12 
 
 		 1118 aa  1280    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  48.03 
 
 		 1029 aa  972    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  39.44 
 
 		 939 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  46.62 
 
 		 1022 aa  946    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  42.41 
 
 		 1004 aa  757    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  37.68 
 
 		 915 aa  633  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  37.63 
 
 		 862 aa  629  1e-179  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  37.82 
 
 		 862 aa  631  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  37.75 
 
 		 863 aa  631  1e-179  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  35.43 
 
 		 911 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  35.52 
 
 		 939 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  37.6 
 
 		 862 aa  627  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  37.01 
 
 		 912 aa  628  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  35.52 
 
 		 911 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  36.04 
 
 		 1024 aa  621  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  35.39 
 
 		 911 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  40.52 
 
 		 869 aa  619  1e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  41.95 
 
 		 868 aa  614  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  35.73 
 
 		 913 aa  614  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  37.17 
 
 		 1010 aa  614  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  36.53 
 
 		 903 aa  610  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  35.73 
 
 		 914 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  35.61 
 
 		 914 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  35.47 
 
 		 916 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  35.71 
 
 		 897 aa  602  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  35.82 
 
 		 910 aa  598  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  35.46 
 
 		 897 aa  598  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0623  preprotein translocase, SecA subunit  36.48 
 
 		 867 aa  593  1e-168  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  40.7 
 
 		 855 aa  595  1e-168  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  37.11 
 
 		 904 aa  590  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  34.93 
 
 		 992 aa  592  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  37.11 
 
 		 904 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  34.99 
 
 		 910 aa  591  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  34.94 
 
 		 916 aa  589  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  37.11 
 
 		 904 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  36.65 
 
 		 909 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3607  preprotein translocase, SecA subunit  36.61 
 
 		 890 aa  586  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4428  preprotein translocase subunit SecA  34.79 
 
 		 934 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  35.2 
 
 		 901 aa  582  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  35.2 
 
 		 901 aa  582  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  35.2 
 
 		 901 aa  582  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  35.2 
 
 		 901 aa  582  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  35.2 
 
 		 901 aa  581  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  35.2 
 
 		 901 aa  582  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  35.2 
 
 		 901 aa  582  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  35.2 
 
 		 901 aa  582  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  35.2 
 
 		 901 aa  582  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  36.68 
 
 		 920 aa  582  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  36.17 
 
 		 913 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  34.96 
 
 		 913 aa  569  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3205  preprotein translocase, SecA subunit  33.72 
 
 		 1032 aa  558  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0589  preprotein translocase subunit SecA  36.43 
 
 		 853 aa  515  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0990  preprotein translocase subunit SecA  33.18 
 
 		 944 aa  507  9.999999999999999e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  45.11 
 
 		 859 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  47.17 
 
 		 830 aa  491  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  47.23 
 
 		 845 aa  483  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  45.52 
 
 		 840 aa  482  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  45.34 
 
 		 845 aa  482  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  45.25 
 
 		 796 aa  480  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  43.92 
 
 		 866 aa  477  1e-133  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  42.48 
 
 		 907 aa  478  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  41.69 
 
 		 834 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  43.16 
 
 		 881 aa  476  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  42.2 
 
 		 908 aa  474  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  40.34 
 
 		 864 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  41.28 
 
 		 907 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  40.17 
 
 		 840 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  40.94 
 
 		 907 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  40.58 
 
 		 907 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  45.9 
 
 		 899 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  40.98 
 
 		 907 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  38.72 
 
 		 858 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  38.85 
 
 		 912 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  41.94 
 
 		 886 aa  466  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  41.12 
 
 		 906 aa  466  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  39.27 
 
 		 907 aa  466  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  40.8 
 
 		 908 aa  463  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  42.38 
 
 		 836 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  41.99 
 
 		 873 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  40.58 
 
 		 908 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  38.64 
 
 		 912 aa  462  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  42.61 
 
 		 896 aa  463  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>