More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0530 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0530  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546421  normal  0.717973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4078  transcriptional regulator, LysR family  94.17 
 
 		 312 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4379  LysR family transcriptional regulator  66.89 
 
 		 301 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5329  LysR family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 301 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0884153  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4957  LysR family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 317 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3410  LysR family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 317 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0692441  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3662  LysR family transcriptional regulator  64.38 
 
 		 306 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6979  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0721  LysR family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal  0.129513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5136  LysR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 323 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390119 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0475  LysR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 301 aa  292  4e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0363  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3979  LysR family transcriptional regulator  53.07 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3540  LysR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0415  LysR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 301 aa  285  5e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3454  transcriptional regulator, LysR family  47.51 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2594  LysR family transcriptional regulator  53.14 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3287  transcriptional regulator, LysR family  47.97 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2922  LysR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 305 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3361  transcriptional regulator, LysR family  51.51 
 
 		 301 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5755  transcriptional regulator, LysR family  45.95 
 
 		 311 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4166  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 310 aa  245  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2363  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 299 aa  242  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2905  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2818  LysR family substrate binding transcriptional regulator  43.99 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.987922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2683  transcriptional regulator, LysR family  42.96 
 
 		 310 aa  231  9e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5851  LysR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4978  transcriptional regulator, LysR family  47.7 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.486149  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0577  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596869 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3339  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0111  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.248059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4360  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 318 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4156  transcriptional regulator, LysR family  43.06 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4228  LysR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2030  transcriptional regulator, LysR family  38.89 
 
 		 305 aa  222  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 305 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2945  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.61 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  41.61 
 
 		 305 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1618  transcriptional regulator, LysR family  42.67 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 312 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3390  transcriptional regulator, LysR family  42.01 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318019  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  39.58 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31030  Transcriptional regulator, LysR family  39.27 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3131  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1558  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.4 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.525706  hitchhiker  0.00043239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  37.63 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1980  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10120  LysR family transcription regulator  40.27 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000385324  normal  0.883998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0915  transcriptional regulator, LysR family  39.67 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 289 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.63 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2356  transcriptional regulator, LysR family  37.15 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118407  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3196  transcriptional regulator, LysR family  37 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00241672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2375  transcriptional regulator, LysR family  38.59 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00507322  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  38.75 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3751  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.587681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3033  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 305 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0273235  normal  0.89504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2698  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 303 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.33 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.866328  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1863  regulatory protein LysR  35.99 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4093  transcriptional regulator, LysR family  37.85 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2679  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0566483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  34.72 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1801  regulatory protein LysR  36.33 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0384326  normal  0.0215354 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  34.72 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1802  regulatory protein LysR:LysR, substrate-binding  36.33 
 
 		 301 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1655  regulatory protein LysR:LysR, substrate-binding  36.33 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>