More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4021 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 166 aa  337  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  66.19 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  68.89 
 
 		 167 aa  191  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  64 
 
 		 167 aa  191  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  68.15 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  60.25 
 
 		 174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  68.15 
 
 		 147 aa  188  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 167 aa  187  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 167 aa  187  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  51.85 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  49.24 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  33.09 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3041  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  30.6 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 184 aa  53.9  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3121  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 193 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.09 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  24.04 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.09 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.09 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.09 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.09 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.09 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  28.09 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 187 aa  50.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  40.24 
 
 		 138 aa  50.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  28.09 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  30.7 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  34.52 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.47 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.47 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.47 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>