192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0628 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 439 aa  841    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  92.99 
 
 		 433 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  54.46 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  61.08 
 
 		 437 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  58.29 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  57.28 
 
 		 425 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  56.37 
 
 		 424 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  57 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  56.69 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  56.69 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  61.24 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  61.24 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  56.31 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0353  major facilitator transporter  67.36 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  57.46 
 
 		 461 aa  319  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4589  major facilitator superfamily transporter  58.14 
 
 		 431 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 384 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 417 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 403 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  29.5 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  29.03 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  33.16 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 410 aa  97.8  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  29.24 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  29.24 
 
 		 415 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  34.24 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  24.01 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  20.42 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  20.19 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  22.43 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  20.15 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  20.15 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  20.15 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  21.85 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  23.11 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  21.12 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  24.14 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  27.57 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  27.57 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  30.82 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.27 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  27.99 
 
 		 917 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 410 aa  54.7  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 408 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  26.7 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  25.35 
 
 		 450 aa  53.5  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 219 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  29.44 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  29.44 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  25.37 
 
 		 912 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  21.83 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 440 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 438 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 438 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  25 
 
 		 895 aa  50.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  28.12 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6596  d-galactonate transporter  28.83 
 
 		 457 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  23.33 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  23.33 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  26.44 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  23.77 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.35 
 
 		 448 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  19.95 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2060  glycerol-3-phosphate transporter  33.87 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0202  d-galactonate transporter  27.36 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317635  unclonable  0.00000000000905697 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 439 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.21 
 
 		 451 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  28.3 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.77 
 
 		 449 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 501 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5451  sn-glycerol-3-phosphate transporter  30.63 
 
 		 449 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00923139 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 446 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  28.3 
 
 		 446 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  27.01 
 
 		 446 aa  47  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>