196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0623 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 190 aa  394  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  97.89 
 
 		 190 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  83.16 
 
 		 190 aa  340  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  68.72 
 
 		 190 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  68.72 
 
 		 185 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  68.72 
 
 		 185 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  63.78 
 
 		 195 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  67.27 
 
 		 165 aa  249  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  68.52 
 
 		 162 aa  248  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  55.62 
 
 		 187 aa  226  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  41.92 
 
 		 177 aa  138  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  35.71 
 
 		 156 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  33.77 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  32.48 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  34.72 
 
 		 168 aa  94  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  33.53 
 
 		 172 aa  93.6  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  34 
 
 		 168 aa  92  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  31.85 
 
 		 300 aa  92  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  34.52 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  33.12 
 
 		 266 aa  89  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  30 
 
 		 155 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  31.58 
 
 		 262 aa  85.5  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  29.63 
 
 		 158 aa  85.5  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  29.33 
 
 		 162 aa  80.9  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  28.76 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  28.48 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  41.03 
 
 		 405 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2249  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 329 aa  57.8  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  26.75 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  30.11 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  32.93 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  24.54 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 		 367 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  37.33 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0264  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 343 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  35.23 
 
 		 388 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  27.71 
 
 		 370 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  30.68 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  35.23 
 
 		 389 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  27.22 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 316 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  27.19 
 
 		 314 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  33.33 
 
 		 426 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  35.9 
 
 		 398 aa  52.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.31 
 
 		 274 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  32.22 
 
 		 378 aa  52  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  32.18 
 
 		 392 aa  52  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  30.59 
 
 		 125 aa  51.2  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  32.56 
 
 		 255 aa  51.2  0.000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  36.99 
 
 		 400 aa  51.2  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  33.75 
 
 		 390 aa  51.2  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  32.41 
 
 		 318 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  32.1 
 
 		 389 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  33.8 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 		 377 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  32.43 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  32.61 
 
 		 355 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  26.82 
 
 		 354 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  27.1 
 
 		 280 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  26.67 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3668  cytochrome-c oxidase  31.03 
 
 		 378 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.253259  normal  0.882679 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  31.82 
 
 		 261 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  27.37 
 
 		 337 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  27.37 
 
 		 337 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  28.74 
 
 		 389 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  28.74 
 
 		 389 aa  48.9  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  28.74 
 
 		 243 aa  48.9  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.49 
 
 		 311 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  30.3 
 
 		 316 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  30.23 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  36.84 
 
 		 275 aa  48.5  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  31.11 
 
 		 647 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  30 
 
 		 315 aa  48.5  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1936  cytochrome c oxidase subunit II  35.87 
 
 		 243 aa  48.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.244228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  31.71 
 
 		 302 aa  48.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  29.7 
 
 		 271 aa  48.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 265 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  30.23 
 
 		 513 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  30.23 
 
 		 353 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 402 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  30.23 
 
 		 345 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  35.62 
 
 		 401 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  25.56 
 
 		 330 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 401 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 401 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  27.63 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  28.08 
 
 		 360 aa  46.6  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  25.67 
 
 		 337 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  27.59 
 
 		 351 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  32.89 
 
 		 388 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  30 
 
 		 356 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3825  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  32.05 
 
 		 318 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  28.05 
 
 		 124 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  31.33 
 
 		 322 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 375 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  32.32 
 
 		 382 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  32.32 
 
 		 382 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  29.49 
 
 		 350 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>