145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6996 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  100 
 
 
271 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  93.26 
 
 
271 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  62.26 
 
 
272 aa  344  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  58.4 
 
 
274 aa  318  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  59.25 
 
 
293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  59.25 
 
 
293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  59.25 
 
 
293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  44.15 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  44.15 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  44.15 
 
 
310 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  43.4 
 
 
310 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  42.96 
 
 
287 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  43.17 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  40.23 
 
 
304 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  41.73 
 
 
312 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  40.23 
 
 
287 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  40.98 
 
 
312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  42.48 
 
 
286 aa  193  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  40.15 
 
 
295 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  40.96 
 
 
308 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  39.77 
 
 
290 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  39.78 
 
 
297 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  38.6 
 
 
302 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  37.59 
 
 
321 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  39.55 
 
 
301 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  40.98 
 
 
296 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  39.47 
 
 
309 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  37.22 
 
 
280 aa  182  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  40.37 
 
 
311 aa  181  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  36.47 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  36.47 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  36.09 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  37.55 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  36.19 
 
 
290 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  40 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  36.5 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  35.27 
 
 
312 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  36.84 
 
 
290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  36.96 
 
 
304 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  37.27 
 
 
273 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  38.01 
 
 
302 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  36.5 
 
 
305 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  37.31 
 
 
289 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  36.23 
 
 
304 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  33.22 
 
 
320 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  35.16 
 
 
307 aa  169  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  36.59 
 
 
312 aa  169  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  36.23 
 
 
304 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  38.2 
 
 
294 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  35.77 
 
 
327 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  35.71 
 
 
314 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  36.71 
 
 
325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  36.59 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  35.64 
 
 
302 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  33.71 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  32.6 
 
 
283 aa  161  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  34.46 
 
 
287 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  34.31 
 
 
302 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  33.58 
 
 
323 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  34.72 
 
 
286 aa  158  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  36.19 
 
 
296 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  33.58 
 
 
313 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
287 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  35.82 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  32.21 
 
 
290 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  35.23 
 
 
286 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  32.83 
 
 
290 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  34.85 
 
 
289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  34.83 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  36.9 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  33.58 
 
 
296 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  34.46 
 
 
295 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
300 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  34.78 
 
 
295 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  44.59 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  44.59 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  33.46 
 
 
295 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  35.05 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  31.39 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  32.35 
 
 
296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  35.74 
 
 
274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  30.94 
 
 
306 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  30.94 
 
 
306 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00939  TIM barrel metal-dependent hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16240)  31.56 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  30.37 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  30.97 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  32.22 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  32.13 
 
 
296 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  30.66 
 
 
282 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01560  conserved hypothetical protein  27.24 
 
 
318 aa  106  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  31 
 
 
298 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  29.96 
 
 
296 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  29.96 
 
 
296 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  29.96 
 
 
296 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  29.96 
 
 
296 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  29.55 
 
 
302 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  31.32 
 
 
276 aa  105  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  29.96 
 
 
296 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  30.26 
 
 
275 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
279 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>