More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6588 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  61.36 
 
 		 613 aa  722    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  61.03 
 
 		 613 aa  718    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  62.85 
 
 		 550 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  60.99 
 
 		 608 aa  698    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  81.91 
 
 		 614 aa  979    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  61.41 
 
 		 665 aa  731    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  62.54 
 
 		 624 aa  714    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  81.8 
 
 		 614 aa  979    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  62.38 
 
 		 624 aa  714    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  62.85 
 
 		 624 aa  718    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  63.02 
 
 		 621 aa  717    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  62.54 
 
 		 624 aa  714    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 611 aa  1224    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  59.48 
 
 		 613 aa  709    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  63.81 
 
 		 546 aa  643    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  59.25 
 
 		 551 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  54.38 
 
 		 603 aa  627  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  57.17 
 
 		 582 aa  628  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  59.11 
 
 		 551 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.81 
 
 		 553 aa  623  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  58.77 
 
 		 551 aa  598  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  57.58 
 
 		 557 aa  595  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  58.02 
 
 		 553 aa  594  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.47 
 
 		 552 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  51.12 
 
 		 540 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  51.12 
 
 		 540 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  51.21 
 
 		 540 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  51.21 
 
 		 543 aa  515  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  51.02 
 
 		 543 aa  515  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  47.95 
 
 		 551 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  50.93 
 
 		 543 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  49.44 
 
 		 551 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  49.42 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  51.21 
 
 		 530 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  46.75 
 
 		 545 aa  482  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  50.38 
 
 		 538 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  47.58 
 
 		 531 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  39.86 
 
 		 566 aa  375  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.03 
 
 		 532 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  40 
 
 		 573 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  39.03 
 
 		 565 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  39.12 
 
 		 583 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3727  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.67 
 
 		 665 aa  362  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  40.33 
 
 		 568 aa  361  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  37.39 
 
 		 606 aa  360  5e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  41.25 
 
 		 541 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.28 
 
 		 546 aa  355  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  38.42 
 
 		 546 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  37.24 
 
 		 561 aa  354  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  41.68 
 
 		 538 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3335  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.85 
 
 		 594 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  36.25 
 
 		 522 aa  353  4e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  39.07 
 
 		 546 aa  353  5e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  38.92 
 
 		 549 aa  353  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  38.83 
 
 		 558 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  38.46 
 
 		 547 aa  350  6e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  38.67 
 
 		 549 aa  350  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  37.5 
 
 		 575 aa  349  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 524 aa  349  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  37.48 
 
 		 565 aa  349  9e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  40.48 
 
 		 550 aa  348  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  38.58 
 
 		 579 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  41.4 
 
 		 534 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  35.58 
 
 		 609 aa  347  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  38.55 
 
 		 563 aa  347  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  34.41 
 
 		 564 aa  346  8e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  36.66 
 
 		 588 aa  346  8e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  37.75 
 
 		 593 aa  345  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  38.06 
 
 		 576 aa  345  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  36.99 
 
 		 619 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  38.96 
 
 		 562 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  40.53 
 
 		 534 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  40.26 
 
 		 571 aa  344  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  39.93 
 
 		 544 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  38.06 
 
 		 532 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  39.35 
 
 		 602 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  38.11 
 
 		 571 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  37.25 
 
 		 603 aa  343  5e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.34 
 
 		 575 aa  343  5e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.97 
 
 		 596 aa  343  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.36 
 
 		 548 aa  342  8e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  36.8 
 
 		 593 aa  342  9e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  37.62 
 
 		 570 aa  342  9e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  43.44 
 
 		 545 aa  342  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  38.79 
 
 		 557 aa  341  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  38.12 
 
 		 586 aa  340  4e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  35.98 
 
 		 578 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  39.37 
 
 		 563 aa  340  4e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  40.9 
 
 		 540 aa  340  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  36.32 
 
 		 583 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  37.78 
 
 		 547 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  36.74 
 
 		 640 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  39.05 
 
 		 607 aa  339  9e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  37.04 
 
 		 539 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  39.6 
 
 		 565 aa  339  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  39.2 
 
 		 564 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  37.46 
 
 		 609 aa  338  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  36.65 
 
 		 619 aa  339  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  38.59 
 
 		 543 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.66 
 
 		 584 aa  338  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>