More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3138 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  100 
 
 
492 aa  972    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  85.31 
 
 
490 aa  824    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  85.1 
 
 
490 aa  798    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  65.73 
 
 
490 aa  636    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  65.51 
 
 
490 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  65.51 
 
 
490 aa  624  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  65.51 
 
 
490 aa  624  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  65.51 
 
 
490 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  67.67 
 
 
490 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  65.51 
 
 
490 aa  624  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  64.39 
 
 
490 aa  623  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  65.29 
 
 
490 aa  623  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  65.29 
 
 
490 aa  618  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  66.53 
 
 
486 aa  608  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  61.97 
 
 
490 aa  610  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  64.82 
 
 
490 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  65.91 
 
 
486 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  65.09 
 
 
490 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  66.38 
 
 
486 aa  588  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  65.53 
 
 
486 aa  590  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  64.01 
 
 
486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  51.53 
 
 
492 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  48.97 
 
 
486 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  49.18 
 
 
486 aa  490  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  49.18 
 
 
486 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  49.69 
 
 
492 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  50.86 
 
 
492 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  48.79 
 
 
517 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  43.6 
 
 
490 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  38.31 
 
 
495 aa  288  2e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  34.76 
 
 
507 aa  257  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  35.91 
 
 
489 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  33.4 
 
 
498 aa  210  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  31.08 
 
 
500 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  30.64 
 
 
503 aa  180  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  30 
 
 
503 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  28.15 
 
 
516 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.95 
 
 
516 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  28.16 
 
 
516 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.16 
 
 
516 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  28.16 
 
 
516 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.16 
 
 
516 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.16 
 
 
516 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  28.16 
 
 
516 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  28.16 
 
 
516 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  28.16 
 
 
516 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  28.16 
 
 
516 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  29.8 
 
 
491 aa  166  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  30.05 
 
 
516 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  30.05 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  29.33 
 
 
516 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  29.56 
 
 
516 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  29.52 
 
 
493 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  29.98 
 
 
516 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  29.33 
 
 
516 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  29.47 
 
 
493 aa  158  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  29.13 
 
 
547 aa  158  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  28.74 
 
 
554 aa  158  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  26.42 
 
 
488 aa  157  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  27.27 
 
 
516 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  28.06 
 
 
509 aa  157  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  28.24 
 
 
460 aa  152  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  28.94 
 
 
460 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  29.45 
 
 
572 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  29.51 
 
 
502 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  29.51 
 
 
502 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  29.18 
 
 
464 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  31.27 
 
 
546 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  27.89 
 
 
507 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  24.74 
 
 
492 aa  144  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  28.4 
 
 
549 aa  144  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  27.38 
 
 
461 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  26.85 
 
 
464 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  29.1 
 
 
527 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  29.2 
 
 
529 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  27.95 
 
 
500 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  27.51 
 
 
498 aa  134  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  28.48 
 
 
491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  28.99 
 
 
491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  28.15 
 
 
491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  27.45 
 
 
460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  29.76 
 
 
461 aa  116  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  27.89 
 
 
494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  29.44 
 
 
506 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  26.54 
 
 
530 aa  113  9e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  29.21 
 
 
515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  24.31 
 
 
520 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  25.79 
 
 
492 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  29.54 
 
 
463 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  22.68 
 
 
526 aa  103  8e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  24.79 
 
 
494 aa  100  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  24.91 
 
 
524 aa  99.8  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.44 
 
 
492 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  25.63 
 
 
491 aa  94  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0047  Na+/solute symporter  24.37 
 
 
508 aa  94  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  24.76 
 
 
474 aa  93.6  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  25.34 
 
 
494 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  25.36 
 
 
491 aa  90.5  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3350  Na+/solute symporter  25.2 
 
 
497 aa  90.9  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.56 
 
 
492 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>