More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2738 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  83.96 
 
 		 374 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  82.35 
 
 		 374 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  100 
 
 		 389 aa  786    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  78.51 
 
 		 376 aa  591  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  77.17 
 
 		 380 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  77.17 
 
 		 380 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  73.28 
 
 		 378 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  73.02 
 
 		 378 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  72.82 
 
 		 396 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  73.02 
 
 		 378 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  73.02 
 
 		 378 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  72.75 
 
 		 378 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  71.58 
 
 		 425 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  70.94 
 
 		 381 aa  541  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  75.07 
 
 		 377 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  74.54 
 
 		 377 aa  541  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  74.8 
 
 		 377 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  72.22 
 
 		 378 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  74.27 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  74.27 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  74.27 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  74.27 
 
 		 377 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  69.97 
 
 		 379 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  64.31 
 
 		 368 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  67.01 
 
 		 409 aa  488  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  64.52 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  65.23 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  63.96 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  64.84 
 
 		 388 aa  463  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  62.37 
 
 		 384 aa  461  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  59.27 
 
 		 389 aa  455  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  60.77 
 
 		 425 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  65.09 
 
 		 390 aa  438  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  64.3 
 
 		 390 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  59.78 
 
 		 358 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  57.87 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  51.51 
 
 		 378 aa  354  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  48.5 
 
 		 400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  51 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  50 
 
 		 404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  51.89 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  51.35 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  46.02 
 
 		 414 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  50.82 
 
 		 386 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  58.14 
 
 		 89 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  32.78 
 
 		 231 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  34.51 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  39.25 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  32.67 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  35.07 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  27.27 
 
 		 202 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1753  methyltransferase small  29.7 
 
 		 226 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335045 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  27.63 
 
 		 202 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  31.37 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  33.98 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  36.22 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  33.98 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  32.91 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  34.21 
 
 		 278 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  32.93 
 
 		 292 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  39.42 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.83 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  32.28 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  34.13 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  27.21 
 
 		 208 aa  55.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  25.64 
 
 		 202 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  31.58 
 
 		 297 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  32.78 
 
 		 231 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  32.78 
 
 		 231 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.56 
 
 		 276 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  34.36 
 
 		 307 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  34.17 
 
 		 275 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2340  methyltransferase small  35.16 
 
 		 333 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.271786 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  34.17 
 
 		 345 aa  54.3  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.56 
 
 		 276 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  33.62 
 
 		 578 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  35.51 
 
 		 311 aa  53.9  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36300  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.77 
 
 		 394 aa  53.9  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  28.76 
 
 		 264 aa  53.5  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0545  methyltransferase small  33.73 
 
 		 333 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  32.76 
 
 		 293 aa  53.5  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.45 
 
 		 297 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.64 
 
 		 299 aa  53.5  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0293  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.03 
 
 		 290 aa  53.1  0.000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  30.77 
 
 		 280 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  37.6 
 
 		 304 aa  52.8  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  30.56 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.43 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3417  methyltransferase small  31.45 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  36.25 
 
 		 278 aa  52.4  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.29 
 
 		 295 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  25.16 
 
 		 202 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0685  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  34.62 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  35.79 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  32.74 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.28 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  36.67 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.37 
 
 		 295 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  29.86 
 
 		 241 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002705  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  34.34 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.588026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>