More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0451 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0451  (Uracil-5)-methyltransferase  100 
 
 
397 aa  786    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.222179  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  30.16 
 
 
446 aa  176  8e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  26.76 
 
 
405 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1628  RNA methyltransferase, TrmA family  30.7 
 
 
415 aa  172  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0138  (Uracil-5)-methyltransferase  27.11 
 
 
441 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00300358 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  29.28 
 
 
435 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  31.94 
 
 
419 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1643  RNA methyltransferase, TrmA family  24.83 
 
 
455 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0689931 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  21.79 
 
 
473 aa  159  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  23.97 
 
 
471 aa  156  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6757  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  24.47 
 
 
415 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  27.21 
 
 
458 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1248  RNA methyltransferase, TrmA family  23.82 
 
 
461 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  26.21 
 
 
461 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  26.21 
 
 
461 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1551  RNA methyltransferase  26.12 
 
 
434 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000011157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2873  RNA methyltransferase, TrmA family  22.2 
 
 
428 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608612  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  25.58 
 
 
419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  27.63 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  27.63 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  27.63 
 
 
458 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  27.63 
 
 
458 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  24.25 
 
 
439 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  27.27 
 
 
470 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  27.85 
 
 
458 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  27.63 
 
 
458 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  28.18 
 
 
439 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1927  23S rRNA methyltransferase/RumA  22.25 
 
 
419 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06020  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  24.6 
 
 
444 aa  145  8.000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.14779  hitchhiker  0.000000000313227 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  27.07 
 
 
458 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  26.07 
 
 
440 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  24.13 
 
 
441 aa  143  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0844867 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  27.81 
 
 
455 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  27.27 
 
 
460 aa  143  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  26.7 
 
 
454 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  26.7 
 
 
454 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0678  RNA methyltransferase, TrmA family  27.62 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  24.02 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.59 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1944  (Uracil-5)-methyltransferase  23.67 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4525  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  22.95 
 
 
387 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  28.82 
 
 
468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.41 
 
 
455 aa  139  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2619  RNA methyltransferase  27.98 
 
 
404 aa  139  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  28.91 
 
 
446 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  24.82 
 
 
407 aa  139  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1748  RNA methyltransferase  26.28 
 
 
438 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  29.37 
 
 
451 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  24.88 
 
 
436 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  24.22 
 
 
485 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  25.06 
 
 
460 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1053  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.43 
 
 
450 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0704597  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  25.71 
 
 
455 aa  137  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  21.16 
 
 
457 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  24.71 
 
 
460 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  27.11 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1841  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.04 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2283  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  22.2 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343326  normal  0.393981 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  22.65 
 
 
397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1145  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.21 
 
 
496 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.611309 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0814  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  21.41 
 
 
444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5118  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.49 
 
 
465 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124268  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6262  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.04 
 
 
465 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1817  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.04 
 
 
465 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1523  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  21.18 
 
 
411 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1396  RNA methyltransferase  20.59 
 
 
397 aa  133  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.671396  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  24.28 
 
 
453 aa  133  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  26.77 
 
 
470 aa  132  7.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15760  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  19.66 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.230124  normal  0.545948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1755  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.04 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1728  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.04 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171324  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  26.34 
 
 
454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  25.3 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1849  RNA methyltransferase, TrmA family  22.22 
 
 
437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  24.78 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  27.33 
 
 
446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2092  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.6 
 
 
463 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.75 
 
 
443 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0093271  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2216  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.41 
 
 
439 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00316265  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.1 
 
 
487 aa  131  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24220  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  20.84 
 
 
399 aa  131  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.147194 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  24.07 
 
 
459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  24.03 
 
 
438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1879  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  20.81 
 
 
440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160336  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1295  RNA methyltransferase  23.23 
 
 
476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52190  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  21.3 
 
 
450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.159289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  23.61 
 
 
446 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  25.17 
 
 
456 aa  129  8.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  23.94 
 
 
459 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  27.9 
 
 
448 aa  129  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  25 
 
 
453 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2360  (Uracil-5)-methyltransferase  21.36 
 
 
438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  25 
 
 
453 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1201  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  23.92 
 
 
444 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0455461  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0848  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  21.95 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000210259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  23.94 
 
 
459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  21.88 
 
 
443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1209  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  23.27 
 
 
450 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  21.95 
 
 
460 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4218  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  23.13 
 
 
461 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.076322  normal  0.149124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>