More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3046 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  86.98 
 
 
921 aa  1514    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 
922 aa  1824    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  87.2 
 
 
921 aa  1515    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  87.2 
 
 
921 aa  1515    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  34.64 
 
 
900 aa  416  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
921 aa  385  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.78 
 
 
913 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.23 
 
 
914 aa  338  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.63 
 
 
901 aa  324  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.48 
 
 
894 aa  320  6e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.57 
 
 
910 aa  298  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.71 
 
 
1021 aa  276  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  30.49 
 
 
900 aa  272  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.18 
 
 
867 aa  270  8e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.82 
 
 
880 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.45 
 
 
930 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
947 aa  260  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  27.98 
 
 
947 aa  259  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.12 
 
 
876 aa  258  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  28.32 
 
 
913 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.57 
 
 
900 aa  253  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.56 
 
 
897 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  28.9 
 
 
907 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
904 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.14 
 
 
1019 aa  245  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.18 
 
 
955 aa  243  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7173  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.63 
 
 
928 aa  243  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866663  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  36.4 
 
 
1003 aa  242  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.48 
 
 
896 aa  243  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.72 
 
 
947 aa  238  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.2 
 
 
905 aa  237  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  29.36 
 
 
824 aa  237  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.85 
 
 
924 aa  236  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  24.94 
 
 
902 aa  232  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  30.99 
 
 
887 aa  232  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  27.43 
 
 
924 aa  232  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.5 
 
 
877 aa  231  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  29.46 
 
 
878 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
914 aa  228  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  28.22 
 
 
1336 aa  228  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  27.19 
 
 
904 aa  226  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  28.05 
 
 
960 aa  226  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.05 
 
 
925 aa  226  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  24.97 
 
 
921 aa  224  8e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  27.49 
 
 
913 aa  222  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  30.77 
 
 
903 aa  221  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  30.77 
 
 
903 aa  221  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  28.06 
 
 
907 aa  221  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  28.08 
 
 
907 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  27.33 
 
 
901 aa  219  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  26.54 
 
 
916 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  28.77 
 
 
899 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  26.92 
 
 
933 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  30.25 
 
 
919 aa  214  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.31 
 
 
870 aa  210  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  28.87 
 
 
901 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  32.18 
 
 
917 aa  205  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  28.87 
 
 
901 aa  205  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  28.87 
 
 
901 aa  205  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  28.87 
 
 
901 aa  205  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.74 
 
 
930 aa  204  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  28.87 
 
 
902 aa  205  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  28.12 
 
 
902 aa  201  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.39 
 
 
911 aa  201  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  27.92 
 
 
901 aa  197  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  27.92 
 
 
901 aa  196  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  30.73 
 
 
901 aa  196  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  25.31 
 
 
921 aa  195  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.74 
 
 
901 aa  193  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  27.74 
 
 
901 aa  193  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  27.74 
 
 
901 aa  193  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  27.74 
 
 
901 aa  193  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  27.74 
 
 
901 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  27.74 
 
 
901 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  32.71 
 
 
920 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  35 
 
 
766 aa  189  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.52 
 
 
889 aa  188  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  29.56 
 
 
904 aa  188  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  27.74 
 
 
944 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  31.92 
 
 
910 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.24 
 
 
905 aa  184  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 
905 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  32.08 
 
 
905 aa  183  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.24 
 
 
905 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3097  LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
898 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0989415  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  31.8 
 
 
1110 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1436  GerE family regulatory protein  29.38 
 
 
921 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2039  LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
917 aa  178  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1348  LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
917 aa  178  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.554665  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2330  LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
917 aa  178  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1063  LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
917 aa  178  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  26.62 
 
 
901 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  25.3 
 
 
901 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.03 
 
 
758 aa  174  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  30.05 
 
 
914 aa  171  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.47 
 
 
932 aa  170  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  38.23 
 
 
907 aa  162  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  32.3 
 
 
906 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.81 
 
 
860 aa  157  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  33.73 
 
 
749 aa  156  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>