97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1474 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  315  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  69.33 
 
 
155 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  68 
 
 
172 aa  216  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  69.33 
 
 
155 aa  216  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  69.33 
 
 
155 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  67.33 
 
 
155 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  67.33 
 
 
155 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  67.33 
 
 
155 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  61.18 
 
 
160 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  61.18 
 
 
160 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  60.53 
 
 
160 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  60.54 
 
 
153 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  60.54 
 
 
153 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  59.86 
 
 
153 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.67 
 
 
161 aa  145  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  48.67 
 
 
161 aa  145  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.67 
 
 
161 aa  144  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  48.67 
 
 
161 aa  144  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  51.82 
 
 
161 aa  144  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  48.12 
 
 
170 aa  141  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  44.06 
 
 
170 aa  121  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  39.72 
 
 
190 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  37.76 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.66 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.66 
 
 
159 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.51 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  31.72 
 
 
158 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  38.84 
 
 
332 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  32.84 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  37.07 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  35.51 
 
 
333 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.78 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  34.25 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.64 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.42 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  35.05 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.49 
 
 
172 aa  70.5  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  36.63 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  36.89 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  32.11 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.83 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  37.25 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.83 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  34.45 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  33.33 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.44 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  37.25 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  35.85 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.61 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  38.61 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  33.88 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  33.83 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  32.43 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  37 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  35.09 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  36.08 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  37.25 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  36.63 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.77 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  33.81 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  39.05 
 
 
174 aa  60.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  36.54 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  33.58 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  29.73 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  33.61 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.06 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 
172 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4561  cupin 2 domain-containing protein  35.9 
 
 
151 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  35 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  32.99 
 
 
173 aa  50.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  31.73 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 
130 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.66 
 
 
133 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  32.08 
 
 
177 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1575  DNA-binding protein  29.52 
 
 
249 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1565  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  36.96 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 
114 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 
123 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  36.23 
 
 
113 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.87 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  33.33 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.3 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4272  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2004  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.06 
 
 
141 aa  40.4  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>