More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4868 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  100 
 
 		 418 aa  815    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  80.25 
 
 		 423 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  77.15 
 
 		 420 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  72.32 
 
 		 416 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  52.82 
 
 		 413 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  54.9 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  50.62 
 
 		 413 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  51.83 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  52.06 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  51.9 
 
 		 487 aa  375  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  51.26 
 
 		 415 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  48.73 
 
 		 411 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 404 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  41.99 
 
 		 410 aa  325  9e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  43.49 
 
 		 399 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  43.23 
 
 		 406 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  42.52 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  41.99 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  41.99 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  41.99 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  41.99 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  41.99 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  41.99 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  41.99 
 
 		 404 aa  298  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  41.73 
 
 		 404 aa  296  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  42.34 
 
 		 397 aa  292  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  42.08 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  41.04 
 
 		 397 aa  279  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  37.24 
 
 		 411 aa  272  6e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 410 aa  263  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  39.06 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  39.06 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  38.8 
 
 		 408 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  39.06 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  39.06 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  38.96 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  36.96 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  37.14 
 
 		 403 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  41.11 
 
 		 404 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  41.11 
 
 		 404 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 403 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 403 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  40.85 
 
 		 404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  41.11 
 
 		 404 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  40.85 
 
 		 404 aa  245  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  37.27 
 
 		 409 aa  242  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 		 395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  39.58 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  35.1 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  37.53 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  34.62 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  32.61 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 407 aa  209  7e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  32.88 
 
 		 394 aa  209  7e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  37.53 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 410 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  32.48 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  28.12 
 
 		 401 aa  169  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 410 aa  87  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0180  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  24.07 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 407 aa  76.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  24.04 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4078  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3681  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  21.97 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  23.72 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  28.12 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.18 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  25.56 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_003296  RS00877  multidrug resistance 1 transmembrane protein  26.24 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00243064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  31.58 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.15 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>