More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4817 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  95.95 
 
 		 247 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  95.55 
 
 		 247 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  95.55 
 
 		 247 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  95.14 
 
 		 247 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  94.33 
 
 		 247 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  90.69 
 
 		 247 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  50.62 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  46.41 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  44.08 
 
 		 245 aa  191  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3765  IclR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 272 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  36.55 
 
 		 245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  32.48 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  37.97 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  31.17 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 246 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2930  regulatory proteins, IclR  31.62 
 
 		 243 aa  111  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  36.76 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  35.84 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  32.64 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  30.36 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  34.82 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  32.49 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1454  IclR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  31.42 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0530  IclR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  29.73 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.78 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  31 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  26.43 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  29.74 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  28.31 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0340  IclR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 284 aa  78.6  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.52 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  28.77 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  31.55 
 
 		 281 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  27.87 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0645  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  25.61 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  25.61 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  27.46 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  30.14 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.97 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.07 
 
 		 295 aa  72  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 259 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  30.08 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  24.5 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3492  regulatory proteins, IclR  26 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  29 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  27.19 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  27.81 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  29.2 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  28.93 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.41 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  25.41 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  25.41 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  25.41 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  25.41 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51530  multidrug efflux pump operon transcriptional regulator protein  28.38 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  25.41 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  25.41 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  27.05 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  28.57 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  26.87 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  31.12 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  24.5 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0194  transcriptional regulator, IclR family  29.28 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0903072  decreased coverage  0.000072825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  27.57 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>