88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2192 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  98.84 
 
 
346 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
346 aa  694    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  98.84 
 
 
346 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  85.55 
 
 
346 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  81.82 
 
 
352 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  79.31 
 
 
348 aa  551  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  79.55 
 
 
357 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  66.05 
 
 
336 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  66.36 
 
 
417 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  65.43 
 
 
336 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  65.43 
 
 
336 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  65.43 
 
 
336 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  65.43 
 
 
336 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  66.34 
 
 
473 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  56.77 
 
 
302 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  56.11 
 
 
300 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  55.45 
 
 
314 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  55.45 
 
 
302 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  52.79 
 
 
317 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  51.61 
 
 
303 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  50 
 
 
325 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  50.65 
 
 
325 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  44.84 
 
 
328 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  44.56 
 
 
327 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  42.71 
 
 
300 aa  209  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  39.47 
 
 
305 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  39.8 
 
 
305 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  39.32 
 
 
305 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  38.31 
 
 
305 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  38.64 
 
 
305 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  38.64 
 
 
305 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  36.06 
 
 
298 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  32.63 
 
 
291 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  36.57 
 
 
298 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  33.09 
 
 
291 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  34.85 
 
 
300 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  35.74 
 
 
295 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  35.74 
 
 
295 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  36.94 
 
 
298 aa  142  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  35.02 
 
 
301 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  28.72 
 
 
328 aa  136  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  34.25 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  35.29 
 
 
290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  29.31 
 
 
296 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  33.21 
 
 
462 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  33.21 
 
 
293 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  33.21 
 
 
293 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  33.21 
 
 
293 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  33.21 
 
 
293 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  33.21 
 
 
293 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  33.21 
 
 
295 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  29.97 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  30.46 
 
 
290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  30.46 
 
 
290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  31.67 
 
 
291 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  31.4 
 
 
292 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  31.14 
 
 
330 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  25.55 
 
 
297 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  25.82 
 
 
321 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  30.66 
 
 
289 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  31.95 
 
 
293 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  27.99 
 
 
287 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  24.81 
 
 
285 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
289 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  25.78 
 
 
288 aa  99.4  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  32.03 
 
 
291 aa  95.9  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  31.39 
 
 
306 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  30.95 
 
 
294 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  31.19 
 
 
306 aa  92.8  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  31.64 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1450  alpha/beta hydrolase  42.31 
 
 
104 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
301 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
288 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  27.66 
 
 
284 aa  50.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  26.69 
 
 
329 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  27.91 
 
 
342 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
317 aa  49.3  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  27.81 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  33.6 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  27.23 
 
 
285 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  29.93 
 
 
305 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  27.6 
 
 
278 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  26.8 
 
 
342 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  28.68 
 
 
334 aa  43.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  32.04 
 
 
312 aa  42.7  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>