58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1870 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 492 aa  988    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 567 aa  115  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 510 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 544 aa  99.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 510 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 509 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 571 aa  84  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 549 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  22.2 
 
 		 585 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.08 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.61 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.61 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 553 aa  68.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  23.58 
 
 		 553 aa  67.8  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 541 aa  67  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 522 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  25.37 
 
 		 551 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 557 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 486 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 520 aa  63.2  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 		 552 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 559 aa  60.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 537 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.7 
 
 		 559 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 536 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 542 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  29.06 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.38 
 
 		 537 aa  57.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 552 aa  57.4  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 553 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 454 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  25.21 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.55 
 
 		 552 aa  51.2  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  21.54 
 
 		 523 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  21.27 
 
 		 522 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0369  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 556 aa  47.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  23.74 
 
 		 557 aa  47.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0663  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.8 
 
 		 556 aa  47  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000120034  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 531 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.51 
 
 		 527 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 556 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  21.25 
 
 		 416 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.34 
 
 		 427 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  21.25 
 
 		 416 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.4 
 
 		 564 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>