186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0443 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  100 
 
 
360 aa  717    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  42.9 
 
 
506 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  27.92 
 
 
557 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  30.11 
 
 
531 aa  119  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.91 
 
 
496 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  25.32 
 
 
560 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  25.95 
 
 
508 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  29.24 
 
 
605 aa  93.6  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  32.73 
 
 
524 aa  92  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  32.94 
 
 
587 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  27.49 
 
 
608 aa  90.5  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  27.49 
 
 
611 aa  89  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  25.13 
 
 
557 aa  88.2  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  33.54 
 
 
579 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  27.49 
 
 
616 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  23.61 
 
 
497 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  22.43 
 
 
493 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  23.16 
 
 
497 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  25.71 
 
 
559 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  33.59 
 
 
564 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  33.33 
 
 
607 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  22.89 
 
 
497 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  30.81 
 
 
594 aa  82.8  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  32.2 
 
 
628 aa  81.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  39.07 
 
 
544 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  23.46 
 
 
550 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  25.94 
 
 
581 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  30.77 
 
 
496 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  29.76 
 
 
563 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  34.42 
 
 
569 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  24.74 
 
 
559 aa  78.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  32.14 
 
 
659 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  31.82 
 
 
617 aa  77.4  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  38.46 
 
 
670 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  35 
 
 
583 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  26.5 
 
 
575 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  35 
 
 
584 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  29.1 
 
 
520 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  35.9 
 
 
599 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  34.38 
 
 
617 aa  73.6  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  31.33 
 
 
523 aa  73.6  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  34.38 
 
 
583 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  32.67 
 
 
623 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  34.38 
 
 
628 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  32.53 
 
 
524 aa  72.4  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  33.75 
 
 
582 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  33.33 
 
 
569 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  27.22 
 
 
595 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  33.61 
 
 
674 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  30.91 
 
 
523 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  27.33 
 
 
561 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  24.21 
 
 
579 aa  69.7  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  25.56 
 
 
1144 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  31.08 
 
 
709 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  34.38 
 
 
583 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  26.79 
 
 
626 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  31.5 
 
 
591 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  35.37 
 
 
612 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  31.52 
 
 
664 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  25.45 
 
 
1071 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  33.12 
 
 
590 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  27.78 
 
 
593 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  38.52 
 
 
662 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  26.24 
 
 
592 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  29.56 
 
 
546 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  26.54 
 
 
560 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  30.49 
 
 
524 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  28.16 
 
 
492 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  23.77 
 
 
577 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  38.52 
 
 
674 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  38.6 
 
 
570 aa  63.2  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  23.53 
 
 
500 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  30.16 
 
 
591 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  37.7 
 
 
679 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  26.46 
 
 
643 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  34.69 
 
 
693 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  28.81 
 
 
510 aa  60.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  27.64 
 
 
655 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  27.97 
 
 
679 aa  60.5  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  23.48 
 
 
538 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  31.75 
 
 
589 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  33.33 
 
 
537 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1553  conserved hypothetical protein  24.37 
 
 
998 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  30.87 
 
 
714 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  30.13 
 
 
709 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  28.12 
 
 
1046 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  23.9 
 
 
659 aa  57.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  26.09 
 
 
250 aa  57.4  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  35.16 
 
 
526 aa  57  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  22.75 
 
 
445 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  22.8 
 
 
513 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  29.03 
 
 
590 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  38.18 
 
 
1076 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0795  ATPase-like protein  26.76 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.412059  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  30.58 
 
 
570 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  30.25 
 
 
589 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  30.6 
 
 
427 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  30.99 
 
 
492 aa  53.9  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  27.81 
 
 
582 aa  53.5  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  31.9 
 
 
600 aa  53.1  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>