More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0653 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0653  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  100 
 
 
1169 aa  2261    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0230534  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3389  exonuclease V subunit beta  22.05 
 
 
1203 aa  204  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02668  exonuclease V (RecBCD complex), beta subunit  21.67 
 
 
1180 aa  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501353  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02629  hypothetical protein  21.67 
 
 
1180 aa  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0871  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.63 
 
 
1180 aa  202  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2966  exonuclease V subunit beta  21.63 
 
 
1180 aa  202  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0895  exonuclease V subunit beta  21.63 
 
 
1180 aa  202  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.861993  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3140  exonuclease V subunit beta  21.79 
 
 
1180 aa  201  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2967  exonuclease V subunit beta  21.67 
 
 
1170 aa  201  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.483472  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4085  exonuclease V subunit beta  21.75 
 
 
1180 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3206  exonuclease V subunit beta  21.74 
 
 
1181 aa  195  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.146819  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3042  exonuclease V subunit beta  21.71 
 
 
1180 aa  194  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2171  Exodeoxyribonuclease V  24.12 
 
 
1152 aa  194  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3140  exonuclease V subunit beta  21.58 
 
 
1181 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3157  exonuclease V subunit beta  21.58 
 
 
1181 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3220  exonuclease V subunit beta  21.5 
 
 
1181 aa  192  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3320  exonuclease V subunit beta  21.42 
 
 
1181 aa  191  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.602721 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0914  exonuclease V subunit beta  22.34 
 
 
1194 aa  184  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3814  exonuclease V subunit beta  21.85 
 
 
1183 aa  182  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.0108471 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1904  exodeoxyribonuclease V, 135 kDa subunit  22.68 
 
 
1208 aa  181  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1936  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.56 
 
 
1251 aa  182  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3263  exonuclease V subunit beta  22.72 
 
 
1181 aa  181  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1901  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.95 
 
 
1224 aa  178  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1270  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.34 
 
 
1240 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.36 
 
 
1207 aa  175  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0546  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.9 
 
 
1183 aa  174  6.999999999999999e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2420  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.36 
 
 
1238 aa  172  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2246  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.96 
 
 
1263 aa  172  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.919114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2642  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.84 
 
 
1229 aa  171  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0681  exodeoxyribonuclease V beta chain  24.77 
 
 
1208 aa  172  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002685  exodeoxyribonuclease V beta chain  23.92 
 
 
1224 aa  171  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0761  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.13 
 
 
1223 aa  169  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.238035  normal  0.093599 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3007  exonuclease V subunit beta  21.45 
 
 
1189 aa  168  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03301  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  24.22 
 
 
1212 aa  167  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.88 
 
 
1223 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4671  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.11 
 
 
1224 aa  166  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.08 
 
 
1200 aa  166  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2111  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.01 
 
 
1251 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0689  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.11 
 
 
1229 aa  163  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0221198  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4537  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.25 
 
 
1224 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.227788  normal  0.354601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55670  exodeoxyribonuclease V beta chain  20.83 
 
 
1245 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.80629  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0344  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.32 
 
 
1130 aa  159  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4673  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  19.78 
 
 
1224 aa  159  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0324  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.52 
 
 
1129 aa  158  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.904758 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2025  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.48 
 
 
1224 aa  157  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2148  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.74 
 
 
1259 aa  157  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0777  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.26 
 
 
1230 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2047  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.38 
 
 
1273 aa  155  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.680974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0579  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.99 
 
 
1085 aa  155  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2291  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.14 
 
 
1273 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2279  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.7 
 
 
1273 aa  154  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4565  hypothetical protein  22.7 
 
 
1273 aa  154  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2094  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.38 
 
 
1273 aa  154  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.780628  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.51 
 
 
1168 aa  153  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1774  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.92 
 
 
1274 aa  152  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1852  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.33 
 
 
1269 aa  151  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4851  exodeoxyribonuclease V beta chain  20.2 
 
 
1244 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2547  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.45 
 
 
1198 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.789149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2932  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.45 
 
 
1198 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1986  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  19.81 
 
 
1209 aa  147  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259297  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0681  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.08 
 
 
1230 aa  146  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.639627  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3232  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.27 
 
 
1240 aa  142  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0067022  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.81 
 
 
1269 aa  142  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1614  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  19.68 
 
 
1232 aa  138  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0364449  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.35 
 
 
1203 aa  138  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1981  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.08 
 
 
1259 aa  136  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.335433  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1459  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.25 
 
 
1226 aa  135  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1359  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.49 
 
 
1226 aa  135  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1748  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  19.56 
 
 
1241 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4323  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  19.56 
 
 
1236 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182798  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0804  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  19.93 
 
 
1242 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.888497  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  18.82 
 
 
1234 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  18.72 
 
 
1234 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0918971  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1401  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.37 
 
 
1221 aa  127  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4014  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.74 
 
 
1226 aa  122  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.398722 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14771  UvrD/REP helicase subunit B  24.41 
 
 
1261 aa  120  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.248766 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1814  exodeoxyribonuclease V beta chain  19.78 
 
 
1242 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2088  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  18.45 
 
 
1236 aa  119  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0645  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.08 
 
 
1261 aa  115  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1746  UvrD/REP helicase  19.57 
 
 
1243 aa  114  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1127  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.06 
 
 
1495 aa  112  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.225678  normal  0.0443825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1188  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  18.93 
 
 
1235 aa  111  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.513756  normal  0.625115 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1215  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  18.93 
 
 
1235 aa  112  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.513189  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.58 
 
 
1199 aa  111  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0735  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  18.93 
 
 
2007 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0011  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.78 
 
 
1241 aa  109  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1410  exodeoxyribonuclease V, beta subunit RecB  18.71 
 
 
1208 aa  108  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.828955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0991  exonuclease V subunit beta  21.93 
 
 
1220 aa  105  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1043  exonuclease V subunit beta  21.93 
 
 
1220 aa  105  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3231  exonuclease V subunit beta  21.93 
 
 
1220 aa  105  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1777  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.17 
 
 
1272 aa  103  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000848552 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03906  exodeoxyribonuclease V beta chain  19.71 
 
 
1357 aa  102  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  23.67 
 
 
1149 aa  99.4  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1757  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.03 
 
 
1320 aa  98.6  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.85 
 
 
1200 aa  96.3  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10831  UvrD/REP helicase subunit B  21.38 
 
 
1265 aa  96.3  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.261186  normal  0.314032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0252  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  19.89 
 
 
1111 aa  96.3  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103947  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1624  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.31 
 
 
1240 aa  95.5  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.547512  normal  0.545211 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.19 
 
 
1204 aa  95.5  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.48 
 
 
1276 aa  94.7  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>