More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6420 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  96.87 
 
 		 403 aa  703    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  100 
 
 		 383 aa  748    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  86.95 
 
 		 403 aa  633  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6449  major facilitator transporter  87.73 
 
 		 406 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5584  major facilitator transporter  87.43 
 
 		 406 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5948  major facilitator transporter  87.43 
 
 		 406 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  64.59 
 
 		 401 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1427  major facilitator transporter  50 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.08987  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4416  major facilitator transporter  56.76 
 
 		 408 aa  326  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2104  major facilitator superfamily MFS_1  52.16 
 
 		 404 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965781  normal  0.443718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2144  major facilitator transporter  52.55 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2421  major facilitator superfamily MFS_1  52.28 
 
 		 400 aa  275  8e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.107516 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  30.35 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  21.43 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  24.14 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  24 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  21.98 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  25.6 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  24.91 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  20.87 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1292  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0269507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 440 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 412 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 		 419 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 433 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  23.72 
 
 		 415 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  23.72 
 
 		 415 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 450 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  23.72 
 
 		 415 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0928  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 452 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.554921  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 414 aa  53.5  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 479 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 433 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  24.45 
 
 		 420 aa  53.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  24.02 
 
 		 415 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 453 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 453 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  25 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 453 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 453 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  22.8 
 
 		 449 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  23.89 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  23.89 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>