More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4172 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  91.8 
 
 		 439 aa  768    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  96.13 
 
 		 439 aa  837    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  95.86 
 
 		 435 aa  824    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  95.86 
 
 		 435 aa  824    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  100 
 
 		 439 aa  865    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  99.32 
 
 		 439 aa  860    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  95.86 
 
 		 435 aa  824    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  67.92 
 
 		 441 aa  577  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  68.26 
 
 		 435 aa  565  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  59.66 
 
 		 442 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  52 
 
 		 440 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2261  major facilitator superfamily MFS_1  51.79 
 
 		 442 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  49.3 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  49.18 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  48.07 
 
 		 455 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  52.66 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  49.66 
 
 		 466 aa  378  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  48.82 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  46.76 
 
 		 468 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  49.29 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  45.37 
 
 		 460 aa  359  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3540  major facilitator transporter  52.36 
 
 		 463 aa  359  6e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 		 442 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  44.34 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  45.26 
 
 		 484 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  47.72 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  44.55 
 
 		 461 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  44.55 
 
 		 461 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  44.55 
 
 		 461 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  46.12 
 
 		 444 aa  348  8e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 459 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  46.76 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  43.45 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  47.26 
 
 		 443 aa  346  4e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  42.19 
 
 		 450 aa  345  8e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 459 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  45.81 
 
 		 449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  44.08 
 
 		 460 aa  343  4e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  41.01 
 
 		 458 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  44.15 
 
 		 430 aa  338  8e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 		 431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  43.32 
 
 		 456 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  45.02 
 
 		 442 aa  335  9e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  44.69 
 
 		 443 aa  333  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  44.34 
 
 		 447 aa  332  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.12 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 450 aa  330  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 439 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 439 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.32 
 
 		 437 aa  329  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 439 aa  328  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  43.5 
 
 		 443 aa  328  9e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  43.25 
 
 		 461 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  45.08 
 
 		 430 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  42.5 
 
 		 441 aa  318  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  42.96 
 
 		 430 aa  317  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  40.09 
 
 		 456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 432 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 432 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  43.54 
 
 		 432 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  39.9 
 
 		 463 aa  311  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  42.24 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  44.29 
 
 		 442 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  42.55 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 439 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  40.27 
 
 		 439 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  45.14 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 439 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  44.52 
 
 		 439 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 456 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  39.19 
 
 		 465 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  39.26 
 
 		 482 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  39.03 
 
 		 437 aa  302  8.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 455 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  38.14 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  41.37 
 
 		 454 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  39.72 
 
 		 446 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  38.53 
 
 		 438 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  39.59 
 
 		 439 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  39.81 
 
 		 438 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  40.87 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  39.81 
 
 		 438 aa  300  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  39.81 
 
 		 438 aa  300  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  39.81 
 
 		 438 aa  299  5e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.21 
 
 		 441 aa  299  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  41.15 
 
 		 429 aa  299  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  39.57 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.57 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  39.57 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>