More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1297 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1297  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1395  ABC transporter related  94.02 
 
 		 234 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.858988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0935  ABC transporter related  93.59 
 
 		 234 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1417  ABC transporter related  93.59 
 
 		 234 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1336  ABC transporter related  97.44 
 
 		 234 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4561  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  91.88 
 
 		 234 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1898  ABC transporter related  88.03 
 
 		 234 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  69.23 
 
 		 234 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1827  putative branched amino acid related transport system protein  68.8 
 
 		 234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1673  ABC transporter, ATP-binding protein  68.8 
 
 		 234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1651  ABC transporter, ATP-binding protein  68.8 
 
 		 234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0909  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  68.38 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0722  ABC transporter, ATP-binding protein  68.38 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.452485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1440  ABC transporter, ATP-binding protein  68.38 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0440  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.38 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.81 
 
 		 237 aa  242  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  57.38 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  56.3 
 
 		 237 aa  237  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  51.52 
 
 		 231 aa  228  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  50 
 
 		 239 aa  225  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  47.44 
 
 		 239 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  47.44 
 
 		 239 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  48.71 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  48.72 
 
 		 235 aa  218  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  48.48 
 
 		 231 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  48.05 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  46.75 
 
 		 231 aa  211  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  48.09 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  48.48 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  48.05 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  48.48 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 		 238 aa  208  7e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  52.14 
 
 		 236 aa  207  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  45.45 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  48.05 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  49.78 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 		 238 aa  205  6e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  46.51 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  45.02 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  50.92 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  44.4 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  47 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  45.54 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  42.47 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  41.07 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  44 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  44 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  42.29 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  43.52 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  44.44 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  45.12 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  41.85 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  44.26 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 		 234 aa  171  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.58 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  43.56 
 
 		 234 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  44 
 
 		 234 aa  171  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  43.3 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  43.3 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0149  ABC transporter related  43.3 
 
 		 247 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.744689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  45.74 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  42.86 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  41.94 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  45.29 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  45.29 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  46.29 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  45.12 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  46.23 
 
 		 251 aa  168  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  46.98 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  45.09 
 
 		 823 aa  168  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  42.13 
 
 		 236 aa  168  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  46.7 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  46.7 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  41.98 
 
 		 248 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  46.23 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  40.27 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.36 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  43.05 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  43.06 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  46.23 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  46.23 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  42.4 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  46.46 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3555  ABC transporter related  44.16 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.651056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  41.12 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  41.51 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  47.49 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  45.09 
 
 		 823 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4448  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.28 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  41.3 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  40.44 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  40.19 
 
 		 248 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  41.3 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0434  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.13 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.03996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3817  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 		 228 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  41.94 
 
 		 238 aa  164  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5755  ABC transporter related  42.13 
 
 		 235 aa  164  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.805145  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2420  ABC transporter related  39.56 
 
 		 242 aa  164  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>