169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5800 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5800  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 338 aa  693    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5793  oxidoreductase domain protein  89.55 
 
 		 339 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3697  oxidoreductase domain protein  32.4 
 
 		 327 aa  149  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0402  oxidoreductase, putative  31.32 
 
 		 331 aa  132  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.738462  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0345  putative oxidoreductase  31.46 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.42492  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01940  predicted dehydrogenase  27.06 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  22.95 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  25.45 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  22.46 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  25.96 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 1079 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 1080 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  35 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  20.87 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2113  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.46 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  28.46 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  27.21 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  24.13 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  24.22 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  27.08 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  24.22 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  33.75 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  23.87 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  23.81 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  25.25 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3430  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0734143  normal  0.0102685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  23.83 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  40.28 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  23.82 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  24.27 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  23.98 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  29 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  22.61 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  23.53 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  23.51 
 
 		 354 aa  53.1  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 		 357 aa  52.8  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  21.1 
 
 		 370 aa  52.8  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  25.25 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  24.53 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 		 734 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0344  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 		 400 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.794531  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  23.81 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  24.65 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  21.43 
 
 		 399 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  26.02 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  20.32 
 
 		 399 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  21.58 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1888  oxidoreductase domain protein  24.65 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.854588  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  23.62 
 
 		 393 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  21.63 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1916  oxidoreductase domain protein  23.95 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0311153  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  24.3 
 
 		 343 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  23.44 
 
 		 394 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2206  oxidoreductase domain protein  24.43 
 
 		 316 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.024069  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  24 
 
 		 353 aa  50.4  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  21.99 
 
 		 363 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  24.47 
 
 		 384 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  23.12 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  23.91 
 
 		 355 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  28.19 
 
 		 713 aa  49.7  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1244  oxidoreductase-like  25.13 
 
 		 349 aa  49.7  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  25.91 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  23.57 
 
 		 396 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 388 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 		 355 aa  49.3  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  22.35 
 
 		 369 aa  49.3  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  23.67 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  18.99 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  41.38 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3179  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  24.42 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  25.82 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  29.24 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  22.45 
 
 		 395 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2785  oxidoreductase-like  23.24 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  22.99 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  24.88 
 
 		 349 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 		 359 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1299  oxidoreductase domain-containing protein  23.88 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3571  oxidoreductase domain-containing protein  26.16 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.785153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  22.99 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  25.1 
 
 		 699 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424149 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>