More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4663 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  100 
 
 		 328 aa  668    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  78.64 
 
 		 333 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  75.62 
 
 		 330 aa  511  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  50 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  45.3 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  43.42 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  43.09 
 
 		 310 aa  242  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  43.94 
 
 		 319 aa  236  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  42.03 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  40.46 
 
 		 322 aa  230  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  42.11 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  45.19 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  45.33 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  39.8 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  45.07 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  40.67 
 
 		 321 aa  222  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  42.67 
 
 		 315 aa  220  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  42.33 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  42.33 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  43.56 
 
 		 325 aa  219  6e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  42.07 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  38.92 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  41.69 
 
 		 311 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  40.07 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  42.86 
 
 		 327 aa  215  8e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  39.74 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  42.16 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  43.42 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  39.14 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  39.1 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  39.32 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  38.76 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  41.81 
 
 		 326 aa  209  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  38.06 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  42.44 
 
 		 298 aa  209  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  39.14 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  40.34 
 
 		 305 aa  207  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  41.81 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  41.46 
 
 		 327 aa  206  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  41.12 
 
 		 327 aa  206  6e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  38.11 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  45.07 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  41.52 
 
 		 324 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  37.62 
 
 		 320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  37.12 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  42.38 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  43.46 
 
 		 308 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  42.33 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  40.2 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  39.07 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  38.67 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  37.88 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  40.74 
 
 		 347 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  40 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  41.38 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  41.11 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  43.94 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  43.42 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  39.19 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  39.05 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  37.05 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  38 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  42.02 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  43.09 
 
 		 313 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  41.06 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  37.33 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  38.41 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  40.15 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3641  transketolase, central region  39.48 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  38.26 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  36.79 
 
 		 319 aa  185  9e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  41.16 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  41.47 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  40.28 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  40.24 
 
 		 312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  34.98 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  40 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  40.79 
 
 		 340 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  36.5 
 
 		 333 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  40.97 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  42.36 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  39.77 
 
 		 592 aa  179  5.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  38.52 
 
 		 340 aa  179  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  35.45 
 
 		 317 aa  179  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  40.22 
 
 		 337 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  39.53 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  40.22 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  38.93 
 
 		 332 aa  175  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  39.24 
 
 		 314 aa  176  7e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  37.27 
 
 		 332 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  35.29 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  35.29 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  35.29 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  40.31 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  32.81 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  35.29 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  39.85 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  39.85 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  35.02 
 
 		 310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  39.85 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>