77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4093 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  93.32 
 
 		 418 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  98.81 
 
 		 419 aa  820    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 419 aa  830    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  70.86 
 
 		 422 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  69.06 
 
 		 422 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  69.06 
 
 		 422 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  69.06 
 
 		 422 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  69.06 
 
 		 422 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  68.82 
 
 		 422 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  68.82 
 
 		 422 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  68.82 
 
 		 422 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  61 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  61.98 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  61.98 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  61.98 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  53.19 
 
 		 415 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  35.31 
 
 		 419 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  33.01 
 
 		 415 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  30.13 
 
 		 415 aa  202  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  30.1 
 
 		 424 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 		 424 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  28.11 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  31.13 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  30.14 
 
 		 418 aa  150  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 429 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  27.6 
 
 		 422 aa  143  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 		 443 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  26.8 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  25.89 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  24.81 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  26.88 
 
 		 416 aa  117  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 		 477 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  26.07 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 486 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  21.52 
 
 		 471 aa  103  8e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 421 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.58 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  21.16 
 
 		 475 aa  100  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  25.81 
 
 		 472 aa  100  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 476 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 476 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 485 aa  93.6  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 429 aa  93.6  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 		 478 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 474 aa  90.9  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  23.02 
 
 		 481 aa  90.1  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 423 aa  89.7  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  21.66 
 
 		 472 aa  89.7  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  22.61 
 
 		 424 aa  87.4  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  26.18 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  20.73 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  20.98 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  19.88 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1027  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  20.1 
 
 		 478 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  19.49 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  19.58 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  19.43 
 
 		 484 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  20.1 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  18.77 
 
 		 484 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  18.77 
 
 		 484 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  18.77 
 
 		 484 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  18.77 
 
 		 484 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2225  polysaccharide biosynthesis protein  34.09 
 
 		 495 aa  43.9  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00989737  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>