More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2325 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  99.24 
 
 
418 aa  754    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  98.99 
 
 
418 aa  752    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  99.24 
 
 
418 aa  754    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  99.24 
 
 
417 aa  755    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
397 aa  758    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  98.99 
 
 
397 aa  752    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  99.24 
 
 
417 aa  755    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  53.15 
 
 
418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  50.25 
 
 
427 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  44.02 
 
 
456 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  38.79 
 
 
435 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 
411 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  38.79 
 
 
426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  33.77 
 
 
406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  35.58 
 
 
434 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.69 
 
 
432 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  34.47 
 
 
411 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 
467 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 
420 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  30.08 
 
 
415 aa  126  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  31.78 
 
 
402 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  29.79 
 
 
420 aa  123  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.57 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 
429 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  29.92 
 
 
425 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  31.44 
 
 
416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 
461 aa  113  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  32.85 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  29.36 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
408 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 
432 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 
439 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
451 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
442 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
420 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 
417 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  34.59 
 
 
408 aa  96.7  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4989  hypothetical protein  28.4 
 
 
342 aa  94.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  31.8 
 
 
289 aa  92.8  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
420 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
420 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  29.97 
 
 
417 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  31.18 
 
 
413 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  29.91 
 
 
408 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.67 
 
 
405 aa  86.3  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.67 
 
 
405 aa  86.3  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  29.57 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  29.02 
 
 
427 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  29.27 
 
 
436 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.72 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
447 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.73 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.73 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  28.02 
 
 
461 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 
440 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  25.73 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  30.37 
 
 
426 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.73 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 
442 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  28.93 
 
 
526 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  26.97 
 
 
416 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 
401 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  21.91 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  27 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  25.73 
 
 
420 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 
433 aa  76.3  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 
433 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  21.65 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.57 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  21.94 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  25.79 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  21.94 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  27.99 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  21.65 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  25.15 
 
 
420 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
417 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
444 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  28.86 
 
 
414 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  28.31 
 
 
416 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  22.7 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  21.65 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  22.4 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  27.62 
 
 
429 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  28.72 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  28.72 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  26.3 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  22.83 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  21.65 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  21.65 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>