More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2336 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  83.49 
 
 		 442 aa  703    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1035  major facilitator family transporter  100 
 
 		 445 aa  870    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0604  membrane protein  99.55 
 
 		 445 aa  868    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1274  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0863  membrane protein  99.55 
 
 		 445 aa  868    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2336  membrane protein  100 
 
 		 445 aa  870    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  83.68 
 
 		 442 aa  677    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1121  major facilitator family transporter  99.1 
 
 		 445 aa  862    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1830  major facilitator family transporter  99.55 
 
 		 445 aa  868    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  83.94 
 
 		 442 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  82.76 
 
 		 442 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  83.94 
 
 		 442 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  83.91 
 
 		 442 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2830  major facilitator family transporter  65.52 
 
 		 450 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2859  major facilitator transporter  65.29 
 
 		 433 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  59.23 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4257  major facilitator transporter  63.72 
 
 		 444 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139885  normal  0.0686355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2952  major facilitator transporter  64.62 
 
 		 433 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  46.8 
 
 		 445 aa  341  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  47.73 
 
 		 439 aa  323  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  47.52 
 
 		 443 aa  322  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.62 
 
 		 442 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  42.05 
 
 		 455 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0978  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 		 447 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  42.55 
 
 		 450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  42.55 
 
 		 450 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 450 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  44.15 
 
 		 436 aa  308  9e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  44.09 
 
 		 434 aa  307  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5537  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  42.27 
 
 		 443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  45.96 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  41.04 
 
 		 439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  41.82 
 
 		 435 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 428 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  41.57 
 
 		 464 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 437 aa  300  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  40.38 
 
 		 447 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 437 aa  298  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 448 aa  296  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  45.91 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  41.05 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 455 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  41.49 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  40.6 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  38.43 
 
 		 437 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  40.57 
 
 		 436 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  39.33 
 
 		 434 aa  289  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 459 aa  289  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 448 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 448 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 448 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 448 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1091  major facilitator transporter  44.34 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.768657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  41.96 
 
 		 462 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  39.49 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4601  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 437 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4289  major facilitator superfamily transporter  38.88 
 
 		 437 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 452 aa  286  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4223  major facilitator transporter  38.88 
 
 		 437 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  40.29 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  39.19 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2512  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  38.78 
 
 		 445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 436 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 434 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  40.82 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2198  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 455 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5896  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 455 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193247  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 449 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2181  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 455 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576704  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 437 aa  283  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 441 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 440 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2220  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 453 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.896585  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 459 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 442 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5498  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  40.49 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  40.88 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2475  major facilitator family protein  40.49 
 
 		 429 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2098  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 440 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2426  transporter, major facilitator family  40.49 
 
 		 429 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 		 454 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 		 454 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 434 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 429 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>