More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0018 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 
607 aa  709    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  60.23 
 
 
610 aa  756    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  58.14 
 
 
591 aa  710    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  62.98 
 
 
599 aa  761    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  59.66 
 
 
585 aa  719    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  65.04 
 
 
601 aa  804    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  58.78 
 
 
578 aa  724    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 
579 aa  691    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 
586 aa  724    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  61.05 
 
 
598 aa  749    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 
584 aa  720    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  61.07 
 
 
601 aa  743    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  63.73 
 
 
591 aa  781    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  64.35 
 
 
592 aa  800    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  65.48 
 
 
590 aa  798    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  59.66 
 
 
590 aa  727    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  62.12 
 
 
592 aa  758    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  61.34 
 
 
590 aa  753    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  65.15 
 
 
600 aa  813    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  60.95 
 
 
609 aa  753    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  61.55 
 
 
590 aa  759    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 
572 aa  716    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  56.06 
 
 
584 aa  689    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  57.83 
 
 
1019 aa  697    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  58.56 
 
 
604 aa  712    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
599 aa  1226    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 
600 aa  760    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  60.91 
 
 
599 aa  763    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  60.41 
 
 
596 aa  757    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  59.16 
 
 
596 aa  731    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 
592 aa  702    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 
590 aa  734    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  90.47 
 
 
598 aa  1113    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  59.66 
 
 
590 aa  728    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  61.55 
 
 
601 aa  750    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 
604 aa  750    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 
590 aa  571  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
586 aa  568  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
602 aa  555  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
594 aa  549  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
590 aa  548  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 
592 aa  550  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 
598 aa  551  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
585 aa  550  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
594 aa  550  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 
599 aa  542  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
627 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
592 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 
617 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
594 aa  532  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
583 aa  532  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
596 aa  535  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0668  aspartyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
583 aa  532  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.530416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
591 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
597 aa  534  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
601 aa  531  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
597 aa  534  1e-150  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
589 aa  535  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2047  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
580 aa  533  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0219169  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
594 aa  535  1e-150  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
583 aa  535  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
594 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
601 aa  533  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3132  aspartyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
583 aa  530  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
591 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 
591 aa  529  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
591 aa  531  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 
591 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1359  aspartyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
583 aa  529  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.400527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
600 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
591 aa  530  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
594 aa  529  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
591 aa  529  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
597 aa  530  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
594 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0420  aspartyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
608 aa  528  1e-148  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
591 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
591 aa  527  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 
614 aa  527  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
593 aa  528  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
594 aa  527  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
591 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
608 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1183  aspartyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 
608 aa  526  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000958333  hitchhiker  0.00287943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
600 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
595 aa  525  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
589 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
596 aa  523  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
599 aa  522  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1203  aspartyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
608 aa  524  1e-147  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000120939  decreased coverage  0.0042207 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0649  aspartyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
583 aa  523  1e-147  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.176198  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
599 aa  523  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
596 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
593 aa  522  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
596 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
598 aa  521  1e-147  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
599 aa  525  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1196  aspartyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
584 aa  521  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
593 aa  519  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
610 aa  519  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>