167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1137 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  100 
 
 
301 aa  596  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  80.81 
 
 
297 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  80.48 
 
 
297 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  78.45 
 
 
297 aa  472  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  77.29 
 
 
297 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  79.17 
 
 
297 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  79.17 
 
 
297 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  58.55 
 
 
300 aa  315  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0280  ribonuclease BN  56.18 
 
 
288 aa  294  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  53.9 
 
 
302 aa  285  8e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  48.55 
 
 
288 aa  252  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  48.55 
 
 
286 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  48.55 
 
 
286 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  46.42 
 
 
293 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  48.91 
 
 
293 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  47.79 
 
 
283 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4347  ribonuclease BN  46.79 
 
 
295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2188  ribonuclease BN  47.74 
 
 
317 aa  235  9e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.811945  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  45.49 
 
 
290 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  46.45 
 
 
307 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  45.74 
 
 
307 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2230  ribonuclease BN  47.08 
 
 
315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.956243  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2506  ribonuclease BN  47.08 
 
 
315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000575853  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  44.4 
 
 
298 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0051  YihY family protein  39.35 
 
 
285 aa  195  7e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  34.69 
 
 
288 aa  129  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  34.18 
 
 
299 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  34.18 
 
 
299 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  30.8 
 
 
392 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  27.65 
 
 
283 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  27.69 
 
 
283 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  31.56 
 
 
316 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  27.37 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  24.91 
 
 
274 aa  93.6  4e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  26.91 
 
 
289 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  26.95 
 
 
289 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  26.95 
 
 
289 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  26.95 
 
 
289 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  26.95 
 
 
289 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  26.95 
 
 
289 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  26.95 
 
 
289 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  26.91 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  26.22 
 
 
286 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  28.79 
 
 
277 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  25.66 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  31.58 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  32.69 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  27.8 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  26.18 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  26.18 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  31.01 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  24.46 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  28.93 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  27.54 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  28.9 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  24.71 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  32.21 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  32.21 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  32.21 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  25.79 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  23.84 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  29.18 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  29.18 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  24.54 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  30.77 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  23.77 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  29.73 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0395  YihY family protein  24.3 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  24.41 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  25.44 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  22.81 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  28.68 
 
 
401 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  23.99 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  25.59 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  26.86 
 
 
359 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  27.67 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  27.36 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  25 
 
 
386 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  27.27 
 
 
350 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  27.27 
 
 
350 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  27.27 
 
 
350 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  24.81 
 
 
386 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  25.26 
 
 
402 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  27.06 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  27.57 
 
 
344 aa  60.1  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5922  ribonuclease BN  24.5 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  0.574915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  25.27 
 
 
388 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  25.27 
 
 
388 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25.9 
 
 
328 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  20.07 
 
 
371 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  30.1 
 
 
445 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  23.74 
 
 
319 aa  59.3  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  27.94 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  26.36 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  23.92 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  26.52 
 
 
360 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  24.81 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  26.17 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  25 
 
 
386 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>