57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03131 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  100 
 
 
169 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  99.41 
 
 
169 aa  342  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  99.41 
 
 
169 aa  342  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  98.82 
 
 
169 aa  340  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  25.99 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  26.42 
 
 
190 aa  61.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  28.25 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  28.16 
 
 
190 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1474  general secretion pathway protein H  26.83 
 
 
179 aa  58.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  25.88 
 
 
172 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  29.07 
 
 
191 aa  57.8  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  29.07 
 
 
191 aa  57.8  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  29.07 
 
 
191 aa  57.8  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  29.87 
 
 
204 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  24.55 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  27.44 
 
 
202 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3576  hypothetical protein  29.87 
 
 
187 aa  55.1  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  27.16 
 
 
206 aa  55.1  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1303  general secretion pathway protein H  25.31 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  24.85 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4247  general secretion pathway protein H  42.11 
 
 
177 aa  50.8  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0707676 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  28.37 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  27.66 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  27.66 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  27.66 
 
 
199 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  27.66 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  27.66 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  27.66 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  27.66 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  25.36 
 
 
146 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  23.84 
 
 
193 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  26.82 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  26.98 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  26.98 
 
 
144 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4354  general secretion pathway protein H  26.18 
 
 
190 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0007  general secretion pathway protein H  29.19 
 
 
184 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.183951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0160  general secretion pathway protein H  25.16 
 
 
170 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.90437 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0155  general secretion pathway protein H  25.16 
 
 
170 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  31.47 
 
 
149 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  29.66 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3423  general secretion pathway protein H  28.57 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3134  general secretion pathway protein H  27.73 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0125  general secretion pathway protein H  26.74 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0101  general secretion pathway protein H  22.73 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02834  GspH, hypothetical type II secretion protein  27.73 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000472105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0212  hypothetical protein  30.48 
 
 
216 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4154  hypothetical protein  32.29 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3243  general secretion pathway protein GspH  25.64 
 
 
187 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.793793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3615  general secretion pathway protein H  26.55 
 
 
192 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3408  general secretion pathway protein GspH  27.73 
 
 
187 aa  41.6  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  39.71 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  36.71 
 
 
176 aa  41.2  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  26.04 
 
 
205 aa  40.8  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  29.36 
 
 
182 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  29.68 
 
 
149 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0148  general secretion pathway protein H  23.13 
 
 
210 aa  40.8  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>