More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43780 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  100 
 
 		 262 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  81.51 
 
 		 266 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  83.46 
 
 		 256 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  68.48 
 
 		 265 aa  350  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.88 
 
 		 256 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  64.54 
 
 		 264 aa  338  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  66.27 
 
 		 256 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  64.86 
 
 		 260 aa  335  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.27 
 
 		 264 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  64.03 
 
 		 261 aa  335  5e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  65.1 
 
 		 256 aa  332  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3873  ABC transporter related  67.45 
 
 		 256 aa  330  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  66.53 
 
 		 277 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  66.93 
 
 		 277 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  61.39 
 
 		 306 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  60.78 
 
 		 313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  59.22 
 
 		 260 aa  308  8e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  58.82 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  58.73 
 
 		 277 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  55.76 
 
 		 274 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  58.82 
 
 		 261 aa  303  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  58.2 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  57.65 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  59.13 
 
 		 272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  57.81 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  57.25 
 
 		 260 aa  301  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  58.04 
 
 		 261 aa  299  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  57.81 
 
 		 263 aa  298  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  58.04 
 
 		 261 aa  298  6e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  56.75 
 
 		 273 aa  298  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  57.25 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  56.86 
 
 		 260 aa  296  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  54.85 
 
 		 274 aa  295  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  55.95 
 
 		 274 aa  291  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  55.95 
 
 		 279 aa  291  8e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  57.54 
 
 		 272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  54.62 
 
 		 296 aa  275  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  60.09 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  52.11 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  54.58 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  50.97 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  51.97 
 
 		 296 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  52.19 
 
 		 275 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  52.38 
 
 		 270 aa  261  8e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  52.21 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  52.17 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  50.6 
 
 		 280 aa  257  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  50 
 
 		 277 aa  254  7e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.79 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  48.8 
 
 		 266 aa  252  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  51.78 
 
 		 268 aa  251  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.01 
 
 		 269 aa  251  7e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  50.6 
 
 		 276 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.43 
 
 		 305 aa  249  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  47.84 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  48.21 
 
 		 269 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  49.01 
 
 		 265 aa  248  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  49.42 
 
 		 289 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  50.59 
 
 		 274 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  50.4 
 
 		 294 aa  246  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  48.83 
 
 		 274 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  49.21 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 285 aa  242  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  48.41 
 
 		 265 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 292 aa  239  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1438  ABC transporter related  57.14 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409389  hitchhiker  0.00000418659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 291 aa  237  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  48.43 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  48.62 
 
 		 612 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  47.62 
 
 		 276 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  48.03 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  48.59 
 
 		 250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  43.66 
 
 		 276 aa  234  7e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  44.44 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  49.61 
 
 		 264 aa  231  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  44.31 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  44.36 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.68 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  48 
 
 		 268 aa  225  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  43.7 
 
 		 265 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  46.18 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  42.31 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  45.14 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  45.63 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  45.63 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  45.02 
 
 		 293 aa  222  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  44.22 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  42.4 
 
 		 252 aa  221  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  42.8 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 256 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  42.4 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  44.22 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  42 
 
 		 264 aa  220  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  44.8 
 
 		 262 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 		 255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  43.37 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>