236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_06060 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  100 
 
 
251 aa  504  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  60 
 
 
249 aa  293  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  58.57 
 
 
249 aa  292  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  56.8 
 
 
249 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  56.97 
 
 
249 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  55.42 
 
 
249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  55.42 
 
 
249 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  58.57 
 
 
248 aa  276  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  58.23 
 
 
249 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  55.42 
 
 
248 aa  268  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  56 
 
 
249 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  36.82 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  36.59 
 
 
256 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  36.79 
 
 
244 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  30.45 
 
 
242 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.67 
 
 
252 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  33.59 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  30.94 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  30.94 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  30.94 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  30.94 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  30.94 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  31.42 
 
 
259 aa  91.7  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  30.57 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  31.44 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  32.79 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  31.98 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  29.25 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  35.05 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  30.59 
 
 
270 aa  89  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  31.2 
 
 
262 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  30.36 
 
 
266 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  29.05 
 
 
270 aa  88.6  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  28.74 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  29.92 
 
 
266 aa  86.3  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  30.2 
 
 
265 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  30.2 
 
 
265 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  28.28 
 
 
242 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  31.2 
 
 
262 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  29.8 
 
 
266 aa  85.5  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.61 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.23 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  27.82 
 
 
289 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  29.92 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  29.69 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  29.32 
 
 
255 aa  82  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  30.12 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  33.7 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  30.12 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  28.69 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  29.02 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  29.72 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  27.2 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  30.31 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  36.59 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  30.06 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  31.06 
 
 
244 aa  72  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  25.5 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  31.64 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  30.38 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  35 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  28.69 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  30.48 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  34.18 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.59 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.46 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  28.26 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  29.03 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  29.25 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  30.67 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  31.55 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  31.07 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  27.56 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  28.75 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  29.41 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  27.13 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.7 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.71 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  27.09 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  32.57 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  23.64 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  27.13 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.04 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  29.33 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  28.66 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  32.85 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  32.5 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  31.72 
 
 
272 aa  63.2  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  28.12 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  29.57 
 
 
264 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  31.6 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  30.46 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  30.46 
 
 
221 aa  62.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  25.43 
 
 
255 aa  62.4  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  28.4 
 
 
258 aa  62.4  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.59 
 
 
254 aa  62  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  25.78 
 
 
254 aa  62  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  31.65 
 
 
268 aa  62  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.35 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  25.48 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>