More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2180 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 346 aa  703    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  44.87 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  47.75 
 
 		 351 aa  294  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  45.17 
 
 		 366 aa  292  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  43.89 
 
 		 360 aa  291  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  44.21 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  43.91 
 
 		 363 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  41.64 
 
 		 380 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  44.8 
 
 		 358 aa  289  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  43.63 
 
 		 363 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  44.86 
 
 		 354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  44.54 
 
 		 360 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  44.54 
 
 		 360 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  45.32 
 
 		 358 aa  288  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  44.82 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  44.82 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  42.49 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.13 
 
 		 352 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  50.69 
 
 		 349 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  46.53 
 
 		 350 aa  286  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  43.71 
 
 		 352 aa  285  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 381 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.53 
 
 		 369 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2735  ABC transporter related  46.15 
 
 		 370 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0804319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  45.13 
 
 		 367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.71 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  43.24 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  43.1 
 
 		 348 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  43.66 
 
 		 366 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.24 
 
 		 369 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  44.21 
 
 		 364 aa  281  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  54.47 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.94 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.41 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.88 
 
 		 369 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  48.95 
 
 		 357 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  47.57 
 
 		 350 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  47.33 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  41.44 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  50.34 
 
 		 363 aa  280  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  43.11 
 
 		 335 aa  280  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  54.04 
 
 		 356 aa  279  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  44.54 
 
 		 333 aa  279  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  42.49 
 
 		 353 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.12 
 
 		 350 aa  279  6e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.74 
 
 		 351 aa  279  6e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  48.61 
 
 		 364 aa  279  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  43.19 
 
 		 356 aa  278  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2056  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.938805  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  44.55 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0696  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 		 350 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.94 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  44.44 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  41.64 
 
 		 365 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  47.33 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  47.67 
 
 		 355 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  43.44 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  46.67 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.25 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  43.88 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.33 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 349 aa  276  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  53.19 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  42.49 
 
 		 353 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46 
 
 		 349 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  43.6 
 
 		 355 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  41.32 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  42.51 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6870  ABC transporter related  48.95 
 
 		 391 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4137  ABC transporter related  46.67 
 
 		 335 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  47.96 
 
 		 353 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.04 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  49.64 
 
 		 363 aa  275  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  49.47 
 
 		 364 aa  276  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  42.69 
 
 		 336 aa  275  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.75 
 
 		 360 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  48.17 
 
 		 380 aa  275  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4187  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.18 
 
 		 353 aa  275  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  45.71 
 
 		 354 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 353 aa  275  7e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2168  ABC transporter related  41.97 
 
 		 355 aa  275  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.184244  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  42.86 
 
 		 356 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  44.51 
 
 		 354 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  44.05 
 
 		 351 aa  275  9e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.5 
 
 		 353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  51.46 
 
 		 355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  49.29 
 
 		 352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  50.8 
 
 		 353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  47.97 
 
 		 372 aa  274  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 363 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  42.24 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  43.31 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.46 
 
 		 365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.46 
 
 		 365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  44.44 
 
 		 361 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  44.2 
 
 		 354 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.34 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  41.36 
 
 		 361 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  47 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>