More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3253 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 
2093 aa  4351    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.83 
 
 
1602 aa  575  1.0000000000000001e-162  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.81 
 
 
1561 aa  550  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.06 
 
 
1525 aa  535  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.32 
 
 
1607 aa  534  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.75 
 
 
1542 aa  526  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.26 
 
 
1543 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.26 
 
 
1543 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.79 
 
 
1787 aa  434  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  25.74 
 
 
1578 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.7 
 
 
1759 aa  365  4e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.52 
 
 
1589 aa  242  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  28.12 
 
 
1784 aa  242  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  26.41 
 
 
2097 aa  210  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  26.75 
 
 
2104 aa  210  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.43 
 
 
2104 aa  209  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.5 
 
 
2104 aa  209  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  26.32 
 
 
1422 aa  196  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.81 
 
 
2120 aa  189  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  25.8 
 
 
2106 aa  187  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.27 
 
 
1741 aa  183  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.89 
 
 
1861 aa  181  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.62 
 
 
685 aa  169  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.85 
 
 
2099 aa  167  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.22 
 
 
1764 aa  168  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.87 
 
 
1740 aa  166  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  25.39 
 
 
1878 aa  164  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  28.57 
 
 
2087 aa  163  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.04 
 
 
2104 aa  161  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.57 
 
 
2136 aa  160  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  33.42 
 
 
2082 aa  159  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  32.38 
 
 
2124 aa  155  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.34 
 
 
1672 aa  152  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.29 
 
 
1698 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.05 
 
 
1734 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.53 
 
 
2113 aa  145  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.1 
 
 
1722 aa  143  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.31 
 
 
2113 aa  142  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  27.31 
 
 
2113 aa  142  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.25 
 
 
2113 aa  141  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  32.04 
 
 
2125 aa  140  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.56 
 
 
1723 aa  138  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  33.25 
 
 
1780 aa  137  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25 
 
 
1741 aa  137  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.8 
 
 
1711 aa  137  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.87 
 
 
1743 aa  134  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  30.59 
 
 
1838 aa  134  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  29.59 
 
 
459 aa  133  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.71 
 
 
1770 aa  133  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.83 
 
 
2213 aa  133  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.46 
 
 
1948 aa  132  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.55 
 
 
1695 aa  131  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  30.06 
 
 
2224 aa  128  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.49 
 
 
1711 aa  127  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.78 
 
 
1719 aa  120  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.49 
 
 
1723 aa  119  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.86 
 
 
1725 aa  115  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  22.27 
 
 
1704 aa  110  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.6 
 
 
1754 aa  105  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.29 
 
 
1765 aa  95.1  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.1 
 
 
739 aa  85.9  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.79 
 
 
744 aa  83.2  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2842  DEAD/DEAH box helicase-like  27.71 
 
 
321 aa  82  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.567167 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.6 
 
 
744 aa  80.5  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  39.64 
 
 
797 aa  77  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.71 
 
 
759 aa  75.5  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  36.19 
 
 
1210 aa  74.7  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  25.45 
 
 
815 aa  73.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.38 
 
 
758 aa  73.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.83 
 
 
751 aa  73.2  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.93 
 
 
744 aa  72.8  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  25.51 
 
 
758 aa  72.4  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4387  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.28 
 
 
1489 aa  71.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351978  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.26 
 
 
685 aa  72  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.11 
 
 
764 aa  71.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.77 
 
 
740 aa  70.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.83 
 
 
768 aa  70.5  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.87 
 
 
868 aa  70.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000944502  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2984  helicase superfamily protein  33.87 
 
 
862 aa  70.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000404432  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.23 
 
 
803 aa  70.1  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.58 
 
 
752 aa  70.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.29 
 
 
753 aa  70.1  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27 
 
 
751 aa  69.3  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.04 
 
 
815 aa  68.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.14 
 
 
756 aa  67.8  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.77 
 
 
959 aa  67.4  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.45 
 
 
744 aa  67  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_840  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  32.43 
 
 
764 aa  66.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.69 
 
 
897 aa  66.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.21 
 
 
764 aa  65.9  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.53 
 
 
808 aa  65.9  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  24.19 
 
 
931 aa  65.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.71 
 
 
805 aa  65.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.13 
 
 
773 aa  65.1  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  25.37 
 
 
912 aa  64.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.69 
 
 
962 aa  63.9  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.82 
 
 
829 aa  63.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0390  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.71 
 
 
876 aa  63.2  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48177  predicted protein  25.35 
 
 
1321 aa  63.2  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  24.82 
 
 
740 aa  62.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>