47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2778 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  100 
 
 		 409 aa  816    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  71.75 
 
 		 417 aa  531  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  37.44 
 
 		 1308 aa  140  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.96 
 
 		 1154 aa  132  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  35.31 
 
 		 760 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  34.34 
 
 		 688 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  33.54 
 
 		 3193 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.86 
 
 		 1372 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  34.59 
 
 		 470 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  34.83 
 
 		 940 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  34.52 
 
 		 690 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  34.01 
 
 		 912 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  36.33 
 
 		 3041 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  30.59 
 
 		 828 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  35.27 
 
 		 861 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  27.89 
 
 		 506 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  31.68 
 
 		 539 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.25 
 
 		 1019 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  27.84 
 
 		 1094 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  29.87 
 
 		 1275 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  27.37 
 
 		 974 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  27.25 
 
 		 1126 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.65 
 
 		 621 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  26.82 
 
 		 1557 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  27.08 
 
 		 604 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  29.27 
 
 		 2807 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 620 aa  60.1  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.18 
 
 		 1838 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  28.78 
 
 		 1490 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  26.09 
 
 		 872 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  26.3 
 
 		 534 aa  53.5  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.72 
 
 		 635 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.51 
 
 		 1340 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  26.34 
 
 		 883 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  24.74 
 
 		 780 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  30.13 
 
 		 514 aa  49.7  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  27.8 
 
 		 491 aa  49.7  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.09 
 
 		 1009 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.99 
 
 		 959 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  26.89 
 
 		 1201 aa  46.6  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.23 
 
 		 2194 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.33 
 
 		 1012 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  24.23 
 
 		 813 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1289 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  23.56 
 
 		 1124 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  26.59 
 
 		 1328 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  24.67 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>