More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2849 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2849  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 387 aa  754    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3943  cystathionine gamma-synthase  67.63 
 
 		 382 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5539  Cystathionine gamma-synthase  63.61 
 
 		 390 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.904525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24950  cystathionine gamma-synthase  63.71 
 
 		 393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8098  Cystathionine gamma-synthase  54.43 
 
 		 399 aa  360  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  39.49 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  40.66 
 
 		 392 aa  246  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  39.13 
 
 		 392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  38.23 
 
 		 401 aa  246  6e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  39.75 
 
 		 413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  34.61 
 
 		 392 aa  243  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  36.67 
 
 		 393 aa  239  6.999999999999999e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  41.48 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  41.47 
 
 		 392 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  41.47 
 
 		 392 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  39.73 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  41.47 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  37.44 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  40.93 
 
 		 397 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  40.88 
 
 		 391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  40.88 
 
 		 391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  41.21 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  38.87 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  41.18 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  41.18 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  36.09 
 
 		 386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  40.05 
 
 		 393 aa  233  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  39.56 
 
 		 397 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  36.67 
 
 		 385 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  40.88 
 
 		 391 aa  232  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  39.57 
 
 		 396 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  39.19 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  39.29 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  38.17 
 
 		 394 aa  229  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  40.21 
 
 		 391 aa  229  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  42.01 
 
 		 392 aa  229  8e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  39.29 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  39.29 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  39.29 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  39.29 
 
 		 390 aa  226  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  39.01 
 
 		 397 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  36.41 
 
 		 386 aa  226  7e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  36.22 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  39.46 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  43.02 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  41.24 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  39.23 
 
 		 396 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  38.72 
 
 		 400 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  42.05 
 
 		 401 aa  223  6e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  35.86 
 
 		 399 aa  222  8e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  40.98 
 
 		 426 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.66 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  40.38 
 
 		 392 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  40.98 
 
 		 426 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  37.15 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  36.11 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.02 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  36.34 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  41.93 
 
 		 378 aa  220  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  38.3 
 
 		 400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  43.02 
 
 		 383 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  36.34 
 
 		 377 aa  219  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  36.5 
 
 		 378 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  37.44 
 
 		 397 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  35.82 
 
 		 377 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.22 
 
 		 396 aa  219  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  36.34 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  36.08 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  36.34 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  36.34 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  36.34 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  36.34 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  36.08 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  41.07 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.16 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  36.8 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  37.72 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  37.08 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.14 
 
 		 403 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  37.43 
 
 		 393 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.24 
 
 		 403 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.24 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  36.08 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.5 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0544  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.12 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  35.66 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1981  cystathionine gamma-synthase  39.59 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.24 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.71 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  39.04 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.18 
 
 		 408 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  38.01 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  40.62 
 
 		 390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1897  cystathionine gamma-synthase  39.88 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.769233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  40.12 
 
 		 378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.15 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  38.86 
 
 		 381 aa  212  7e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  37.72 
 
 		 378 aa  212  9e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.05 
 
 		 403 aa  212  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  36.64 
 
 		 400 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>