222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2627 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2627  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2360  ApbE family lipoprotein  66.44 
 
 		 290 aa  358  6e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000706086 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2154  ApbE family lipoprotein  49.47 
 
 		 287 aa  255  5e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1291  ApbE family lipoprotein  43.88 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.710022  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1526  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  35.84 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0153  thiamine biosynthesis lipoprotein, ApbE family  29.83 
 
 		 349 aa  108  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.191913 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  30.34 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  31.1 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  33.76 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  27.24 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2585  ApbE-like lipoprotein  30.85 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.501359  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  29.21 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  26.75 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  29.37 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.02 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  25.86 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  31.76 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  30.2 
 
 		 346 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  30.2 
 
 		 346 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  29.69 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.12 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  31.76 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  27.27 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  32.09 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  32.14 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  25.38 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  24.78 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  26.27 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  35.98 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  22.59 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  27.27 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  26.64 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  28.46 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  26.92 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  26.8 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  25.63 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  26.92 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  23.12 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  24.81 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  28.46 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  28.57 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  26.69 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.31 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  28.49 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  28.1 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  27.97 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  30.05 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  26.02 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1186  ApbE family lipoprotein  30.77 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0352655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  27.41 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  34.65 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  30.58 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.49 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  34.31 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  28.91 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  24.79 
 
 		 332 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.3 
 
 		 351 aa  57  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  24.24 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  32.79 
 
 		 417 aa  57  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  26.78 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  22.92 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  30.46 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.83 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  25.76 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  31.53 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.38 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  24.38 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  26.67 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  24.38 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  24.1 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  24.19 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  24.19 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  25.52 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.31 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.19 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  30.15 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  28.22 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  24.79 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.19 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  31.9 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  25.61 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  32.52 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.78 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  24.19 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  25.82 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  25.82 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.31 
 
 		 350 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.31 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.19 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  25.82 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  25.82 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.31 
 
 		 350 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  25.56 
 
 		 341 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.08 
 
 		 351 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  27.27 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0899  ApbE family protein  30.18 
 
 		 365 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.624097  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  25.74 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  25.75 
 
 		 380 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  25.95 
 
 		 341 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>