193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1289 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  820    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  89.08 
 
 
443 aa  728    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  52.59 
 
 
421 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  50.26 
 
 
442 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  48.57 
 
 
394 aa  354  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  47.56 
 
 
431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  48.53 
 
 
410 aa  330  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  45.6 
 
 
382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  42.58 
 
 
395 aa  288  9e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  39.89 
 
 
453 aa  239  8e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  32.42 
 
 
407 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  30.56 
 
 
380 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  30.65 
 
 
497 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  26.33 
 
 
391 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  31.03 
 
 
387 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  30.04 
 
 
375 aa  86.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  30.36 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  28.72 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  29.87 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  29.21 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  29.19 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  26.85 
 
 
552 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  28.44 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  25.08 
 
 
451 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  28.78 
 
 
426 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  26.86 
 
 
419 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  36.81 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  29.92 
 
 
431 aa  64.3  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  29.1 
 
 
391 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  26.62 
 
 
479 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  26.6 
 
 
463 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  30.26 
 
 
452 aa  63.2  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  28.38 
 
 
380 aa  63.2  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  26.76 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  24.02 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  27.74 
 
 
404 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  26.89 
 
 
426 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  30.24 
 
 
561 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  27.74 
 
 
362 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  27.74 
 
 
404 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  24.71 
 
 
384 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  27.74 
 
 
404 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  27.74 
 
 
404 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  27.74 
 
 
404 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  25.58 
 
 
384 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  25.58 
 
 
384 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  26.29 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  37.07 
 
 
432 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  43.16 
 
 
302 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  26.86 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  27.1 
 
 
404 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  23.05 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  29.15 
 
 
422 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  30.16 
 
 
428 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  25.18 
 
 
401 aa  57.4  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  31.05 
 
 
431 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  25.56 
 
 
384 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  31.43 
 
 
363 aa  57  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  30.95 
 
 
405 aa  56.6  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  27.83 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  26.53 
 
 
564 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  29.09 
 
 
444 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  34.83 
 
 
391 aa  55.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  25.76 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  24.5 
 
 
432 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  25.95 
 
 
436 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  25.71 
 
 
405 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  25.11 
 
 
392 aa  53.9  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  29.86 
 
 
294 aa  53.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  27.81 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  24.67 
 
 
463 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  30.34 
 
 
430 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  33.62 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  32.6 
 
 
434 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
295 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  29.34 
 
 
430 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  22.99 
 
 
428 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  27.04 
 
 
334 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3054  hypothetical protein  23.02 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.176389  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  33 
 
 
288 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  26.1 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  34.18 
 
 
316 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  32 
 
 
326 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  24.2 
 
 
423 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  28.46 
 
 
393 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  35.38 
 
 
430 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  37 
 
 
433 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  33.67 
 
 
386 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  28.21 
 
 
575 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  24.88 
 
 
398 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  27.21 
 
 
267 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3053  hypothetical protein  23.02 
 
 
387 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2736  hypothetical protein  23.02 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  34.83 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  41.18 
 
 
320 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  27.69 
 
 
412 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  37.93 
 
 
437 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  24.14 
 
 
290 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  26.26 
 
 
443 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  36.92 
 
 
455 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>