More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1432 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2652  M20/DapE family protein YgeY  72.5 
 
 		 443 aa  659    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1663  M20/DapE family protein YgeY  75.17 
 
 		 436 aa  670    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1432  peptidase  100 
 
 		 445 aa  920    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0240  peptidase  66.36 
 
 		 460 aa  599  1e-170  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000787577  normal  0.24947 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02705  hypothetical protein  60.32 
 
 		 403 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0820  M20/DapE family protein YgeY  60.32 
 
 		 403 aa  531  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3197  peptidase  60.55 
 
 		 403 aa  532  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02667  hypothetical protein  60.32 
 
 		 402 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3005  peptidase  60.32 
 
 		 403 aa  531  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4162  peptidase  60.32 
 
 		 403 aa  531  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0836  peptidase  60.32 
 
 		 403 aa  531  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3032  peptidase  60.32 
 
 		 403 aa  531  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  58.62 
 
 		 413 aa  511  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1729  peptidase  56.98 
 
 		 400 aa  504  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  45.88 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  37.38 
 
 		 401 aa  299  6e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  29.56 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0260  peptidase  27.75 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  28.21 
 
 		 394 aa  152  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4537  peptidase  28.71 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.468696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  25.29 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2961  peptidase  28.04 
 
 		 395 aa  136  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1267  peptidase  27.02 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.11 
 
 		 410 aa  108  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  24.78 
 
 		 422 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 422 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  24.22 
 
 		 422 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  23.85 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  24.45 
 
 		 422 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  24.45 
 
 		 422 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  23.64 
 
 		 422 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  24.45 
 
 		 422 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  24.45 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  24.24 
 
 		 422 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.73 
 
 		 381 aa  91.7  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  24.62 
 
 		 422 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  23.5 
 
 		 393 aa  90.1  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25.22 
 
 		 422 aa  87.4  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.65 
 
 		 428 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.19 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.5 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.5 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.87 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  23.21 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.44 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.63 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  29.85 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.46 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  22.07 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  24.56 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  22.22 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  22.61 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.85 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  25.75 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.3 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.71 
 
 		 396 aa  76.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0144  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.91 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0025  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.69 
 
 		 429 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.61 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  24.72 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  25 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  20.87 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  23.82 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  26.67 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  24.93 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  22.04 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  29.52 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  21.81 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1531  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.98 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.79 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3717  acetylornithine deacetylase  22.87 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  21.89 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  27.19 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  24.02 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.47 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  28.22 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  24.72 
 
 		 383 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.49 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.39 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 383 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.97 
 
 		 400 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  27.75 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  24.65 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02089  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.21 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569859  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  21.86 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0918  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.15 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  27.52 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.06 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2789  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.9 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.345284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  24.72 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1128  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.9 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  27.34 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>