More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0747 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.49 
 
 		 713 aa  644    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  48.04 
 
 		 718 aa  636    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  48.27 
 
 		 718 aa  646    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.49 
 
 		 713 aa  645    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.07 
 
 		 722 aa  639    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.03 
 
 		 712 aa  643    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 699 aa  1391    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  49.45 
 
 		 720 aa  656    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  49.52 
 
 		 720 aa  655    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.28 
 
 		 713 aa  652    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  47.91 
 
 		 722 aa  633  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  47.36 
 
 		 721 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.28 
 
 		 722 aa  625  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.36 
 
 		 716 aa  616  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.36 
 
 		 716 aa  616  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  46.61 
 
 		 718 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.84 
 
 		 724 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  44.54 
 
 		 716 aa  590  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  45.47 
 
 		 730 aa  586  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  45.47 
 
 		 717 aa  575  1.0000000000000001e-162  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.7 
 
 		 722 aa  569  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.64 
 
 		 706 aa  572  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  44.8 
 
 		 724 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  44.8 
 
 		 724 aa  567  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  44.8 
 
 		 724 aa  567  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.26 
 
 		 722 aa  566  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  44.8 
 
 		 722 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  44.66 
 
 		 722 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  44.66 
 
 		 724 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  45.43 
 
 		 722 aa  566  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  44.52 
 
 		 722 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  45.47 
 
 		 722 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.54 
 
 		 726 aa  562  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  45.32 
 
 		 762 aa  556  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  45.18 
 
 		 721 aa  549  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.06 
 
 		 780 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  43.35 
 
 		 802 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  44.4 
 
 		 721 aa  547  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  45.89 
 
 		 760 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  42.68 
 
 		 779 aa  545  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  42.64 
 
 		 784 aa  543  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  43.71 
 
 		 781 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  42.56 
 
 		 787 aa  545  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  43.72 
 
 		 782 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  42.45 
 
 		 777 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  43.97 
 
 		 727 aa  539  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  44.13 
 
 		 762 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  42.59 
 
 		 788 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0587  RNA binding S1 domain protein  42.29 
 
 		 777 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173141  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  42.74 
 
 		 777 aa  537  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  42.13 
 
 		 765 aa  536  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  44.18 
 
 		 774 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  44.94 
 
 		 728 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3277  RNA binding S1  43.11 
 
 		 799 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.93 
 
 		 720 aa  537  1e-151  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.71 
 
 		 774 aa  536  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2668  RNA binding S1 domain-containing protein  42.05 
 
 		 783 aa  535  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427217  normal  0.51511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.98 
 
 		 774 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  44.38 
 
 		 720 aa  534  1e-150  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  43.04 
 
 		 757 aa  534  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2189  RNA binding S1  42.56 
 
 		 798 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05040  transcriptional accessory protein  43.86 
 
 		 770 aa  534  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.948642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7595  RNA binding S1 domain protein  42.36 
 
 		 797 aa  535  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0669  Tex-like protein protein-like protein  43.72 
 
 		 713 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  44.2 
 
 		 713 aa  532  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  44.04 
 
 		 773 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2945  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.56 
 
 		 776 aa  532  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  44.67 
 
 		 759 aa  529  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0735  RNA binding S1 domain protein  42.22 
 
 		 773 aa  531  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2650  RNA binding S1 domain protein  42.04 
 
 		 795 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00533816  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.27 
 
 		 784 aa  531  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  41.93 
 
 		 782 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08480  transcriptional accessory protein  43.77 
 
 		 775 aa  530  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1079  Tex-like protein protein-like protein  43.22 
 
 		 704 aa  531  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  44.07 
 
 		 754 aa  528  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 710 aa  529  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1460  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.37 
 
 		 773 aa  530  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0675238  normal  0.590936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  43.57 
 
 		 861 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.43 
 
 		 774 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  44.12 
 
 		 774 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1709  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.15 
 
 		 813 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  44.12 
 
 		 774 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  44.12 
 
 		 774 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  43.85 
 
 		 772 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  44.12 
 
 		 774 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0163  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.1 
 
 		 759 aa  528  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0161736  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  43.98 
 
 		 821 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3413  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 777 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.268774 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  44.12 
 
 		 774 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  44.12 
 
 		 774 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1476  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.31 
 
 		 812 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0738998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3402  RNA binding S1  42.86 
 
 		 777 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.71 
 
 		 774 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.23 
 
 		 723 aa  525  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3465  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 777 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520742 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  43 
 
 		 761 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  43.25 
 
 		 767 aa  525  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4188  RNA binding S1 domain protein  43.09 
 
 		 769 aa  522  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  44.41 
 
 		 772 aa  525  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0173  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.27 
 
 		 804 aa  522  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>