More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1087 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  36.07 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  37.72 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  33.87 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  28.19 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  28.69 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  30.3 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  29.51 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  27.87 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  27.72 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4996  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  27.41 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  27.86 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  27.86 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  27.86 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  26.77 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  28.64 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  28.64 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  29.44 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  32.28 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  27 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  27.17 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  26.02 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  34.44 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  31.3 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  26.4 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  26.42 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4968  transcriptional regulator, TetR family domain protein  28.31 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  26.98 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  26.4 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  28.8 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  29.27 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  26.4 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  30 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  26.4 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  27.8 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  26.4 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  26.4 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  26.4 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  29.92 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  26.79 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  29.51 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  29.92 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  27.2 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  27.4 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  24.39 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  27.4 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  27.4 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  27.4 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  28.57 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  28.57 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  27.4 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  31.15 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  27.64 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  27.4 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  27.4 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  32.52 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  26.4 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>