More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0833 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0835  ATP-dependent helicase HrpB  78.25 
 
 
860 aa  1150    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1858  ATP-dependent helicase HrpB  52.19 
 
 
891 aa  690    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0839  ATP-dependent helicase HrpB  78.39 
 
 
860 aa  1147    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0787  ATP-dependent helicase HrpB  78.25 
 
 
860 aa  1150    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368486  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0833  ATP-dependent helicase HrpB  100 
 
 
921 aa  1734    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2232  ATP-dependent helicase HrpB  40.8 
 
 
842 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0479151  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3359  helicase  38.85 
 
 
865 aa  522  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0429272  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2348  ATP-dependent helicase HrpB  40.97 
 
 
842 aa  491  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1349  ATP-dependent helicase HrpB  40.67 
 
 
842 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.228837  hitchhiker  0.00000000348515 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1838  ATP-dependent helicase HrpB  39.89 
 
 
846 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3081  ATP-dependent helicase HrpB  38.9 
 
 
827 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.895104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2470  ATP-dependent helicase HrpB  39.49 
 
 
844 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590615  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1633  Helicase ATP-dependent domain protein  34.72 
 
 
861 aa  437  1e-121  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1180  ATP-dependent helicase HrpB  38.13 
 
 
828 aa  438  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9477e-16 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0359  ATP-dependent helicase HrpB  39.54 
 
 
872 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0455  ATP-dependent helicase HrpB  39.27 
 
 
829 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0585  ATP-dependent helicase HrpB  33 
 
 
835 aa  432  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4854  ATP-dependent helicase HrpB  37.76 
 
 
877 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.951101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0302  ATP-dependent helicase HrpB  37.85 
 
 
825 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4735  ATP-dependent helicase HrpB  36.66 
 
 
840 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.784057  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1573  thiolase  34.64 
 
 
864 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142066  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4651  ATP-dependent helicase HrpB  40.24 
 
 
833 aa  416  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262977  normal  0.748056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0505  ATP-dependent helicase HrpB  37.44 
 
 
870 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.967773 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2061  ATP-dependent helicase HrpB  37.71 
 
 
837 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0816695  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2129  ATP-dependent helicase HrpB  39.47 
 
 
837 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4808  ATP-dependent helicase HrpB  36.5 
 
 
844 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0723  ATP-dependent helicase HrpB  39.38 
 
 
808 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336305  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2013  DEAD/DEAH box helicase  39.38 
 
 
808 aa  399  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3111  ATP-dependent helicase HrpB  39.57 
 
 
808 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577878  normal  0.0241826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1148  ATP-dependent helicase HrpB  38.15 
 
 
838 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658712  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3458  ATP-dependent helicase HrpB  38 
 
 
798 aa  392  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0976  ATP-dependent helicase HrpB  38.9 
 
 
848 aa  391  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0156609  normal  0.918373 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0192  ATP-dependent helicase HrpB  38.52 
 
 
917 aa  389  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135151 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0669  ATP-dependent helicase HrpB  38.24 
 
 
841 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0516  ATP-dependent helicase HrpB  36.56 
 
 
822 aa  386  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.355693 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3110  ATP-dependent helicase  33.07 
 
 
826 aa  388  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.924657  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4194  ATP-dependent helicase HrpB  30.08 
 
 
823 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2844  ATP-dependent helicase HrpB  38.53 
 
 
830 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.454612  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0554  ATP-dependent helicase HrpB  32 
 
 
848 aa  385  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1083  ATP-dependent helicase HrpB  37.37 
 
 
829 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0688  ATP-dependent RNA helicase HrpB  35.92 
 
 
809 aa  381  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0972793  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09990  DEAH-box ATP-dependent helicase HrpB  37.99 
 
 
838 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1172  ATP-dependent helicase HrpB  36.41 
 
 
863 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3739  ATP-dependent helicase HrpB  37.33 
 
 
844 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4935  ATP-dependent helicase HrpB  36.66 
 
 
839 aa  379  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.557516 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0073  ATP-dependent helicase HrpB  36.98 
 
 
824 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4772  ATP-dependent helicase HrpB  36.48 
 
 
842 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0178797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4648  ATP-dependent helicase HrpB  36.59 
 
 
842 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.052727  normal  0.20008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4320  ATP-dependent helicase HrpB  37.17 
 
 
844 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.043486  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3407  ATP-dependent helicase HrpB  32.29 
 
 
835 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.982669  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3895  ATP-dependent helicase HrpB  31.06 
 
 
855 aa  372  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0130  ATP-dependent RNA helicase HrpB  33.85 
 
 
820 aa  372  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0623  ATP-dependent helicase HrpB  32.18 
 
 
835 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0622  ATP-dependent helicase HrpB  32.75 
 
 
835 aa  373  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.53674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3275  ATP-dependent helicase HrpB  35.82 
 
 
821 aa  369  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0632  ATP-dependent helicase HrpB  32 
 
 
835 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2322  ATP-dependent helicase HrpB  34.28 
 
 
834 aa  358  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.334263 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0067  DEAD box-like helicase  35.48 
 
 
820 aa  358  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0419076  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0582  ATP-dependent helicase HrpB  31.37 
 
 
854 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02411  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.7 
 
 
853 aa  355  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41641  predicted protein  37.46 
 
 
936 aa  353  1e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000692526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3793  ATP-dependent helicase HrpB  30.91 
 
 
842 aa  352  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000841118 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1306  ATP-dependent helicase HrpB  36.01 
 
 
900 aa  351  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.493804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12630  putative ATP-dependent helicase  36.34 
 
 
830 aa  350  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0704  ATP-dependent helicase HrpB  30.06 
 
 
869 aa  349  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4319  ATP-dependent helicase HrpB  34.85 
 
 
821 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0127  ATP-dependent helicase HrpB  36.16 
 
 
832 aa  347  5e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00299316  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1773  ATP-dependent helicase HrpB  51.52 
 
 
798 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0295014  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0147  ATP-dependent helicase HrpB  34.93 
 
 
818 aa  343  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210088  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3271  ATP-dependent helicase HrpB  30.36 
 
 
848 aa  342  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1744  ATP-dependent helicase HrpB  38.01 
 
 
855 aa  340  5e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564063  normal  0.839045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1990  ATP-dependent helicase HrpB  38.09 
 
 
843 aa  332  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00135733  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03444  ATP-dependent RNA helicase HrpB  30.56 
 
 
833 aa  330  9e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07780  ATP-dependent helicase HrpB  37.17 
 
 
830 aa  329  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1590  ATP-dependent helicase HrpB  49.67 
 
 
825 aa  321  5e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357448  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0501  ATP-dependent helicase HrpB  45.24 
 
 
833 aa  320  1e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3886  ATP-dependent helicase HrpB  48.15 
 
 
834 aa  317  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.41571 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2159  ATP-dependent helicase HrpB  38.13 
 
 
853 aa  315  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7352  ATP-dependent helicase  46.73 
 
 
824 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0536  ATP-dependent helicase HrpB  46.58 
 
 
825 aa  311  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1261  ATP-dependent helicase HrpB  43.16 
 
 
825 aa  310  9e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0343419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4043  ATP-dependent helicase HrpB  50.99 
 
 
821 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0565  ATP-dependent helicase  44.32 
 
 
833 aa  308  3e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2491  ATP-dependent helicase  38.7 
 
 
718 aa  308  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.041451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0098  ATP-dependent helicase HrpB  47.36 
 
 
826 aa  306  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.310548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3982  ATP-dependent RNA helicase HrpB  47.63 
 
 
812 aa  304  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0579093  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6547  ATP-dependent helicase HrpB  51.38 
 
 
823 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.10181  normal  0.639209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4801  ATP-dependent helicase HrpB  49.76 
 
 
826 aa  298  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.510158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0785  ATP-dependent helicase HrpB  36.84 
 
 
880 aa  295  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363712  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1001  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.88 
 
 
853 aa  294  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3464  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.66 
 
 
829 aa  294  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0648  ATP-dependent helicase HrpB  45.69 
 
 
842 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242487  normal  0.649022 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3335  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.43 
 
 
834 aa  292  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.825067  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2603  ATP-dependent RNA helicase HrpB  38.44 
 
 
821 aa  291  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03270  ATP-dependent RNA helicase  47.58 
 
 
823 aa  290  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  38.91 
 
 
720 aa  289  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1167  ATP-dependent RNA helicase HrpB  44.62 
 
 
814 aa  288  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2972  ATP-dependent helicase HrpB  42.86 
 
 
838 aa  287  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2365  ATP-dependent helicase HrpB  49.43 
 
 
860 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.701913  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002567  ATP-dependent helicase HrpB  40.05 
 
 
822 aa  284  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>