More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0785 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0951  ATP-dependent helicase HrpB  50.9 
 
 		 772 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1727  ATP-dependent helicase HrpB  55.25 
 
 		 856 aa  718    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69515  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6512  ATP-dependent helicase HrpB  60.76 
 
 		 862 aa  868    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1990  ATP-dependent helicase HrpB  62.13 
 
 		 843 aa  862    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00135733  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1244  ATP-dependent helicase HrpB  53.38 
 
 		 836 aa  657    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00036267  normal  0.131071 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07780  ATP-dependent helicase HrpB  53.68 
 
 		 830 aa  705    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3972  ATP-dependent helicase HrpB  54.37 
 
 		 841 aa  723    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18990  ATP-dependent helicase HrpB  56.07 
 
 		 839 aa  689    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.127417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0785  ATP-dependent helicase HrpB  100 
 
 		 880 aa  1669    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1784  ATP-dependent helicase HrpB  46.48 
 
 		 871 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000613438 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2026  ATP-dependent helicase HrpB  45.8 
 
 		 897 aa  520  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.79914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2232  ATP-dependent helicase HrpB  40.09 
 
 		 842 aa  499  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0479151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1838  ATP-dependent helicase HrpB  42.33 
 
 		 846 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1349  ATP-dependent helicase HrpB  40.09 
 
 		 842 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.228837  hitchhiker  0.00000000348515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2348  ATP-dependent helicase HrpB  38.99 
 
 		 842 aa  474  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0505  ATP-dependent helicase HrpB  40.79 
 
 		 870 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.967773 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2061  ATP-dependent helicase HrpB  41.42 
 
 		 837 aa  467  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0816695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4854  ATP-dependent helicase HrpB  40.35 
 
 		 877 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.951101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0302  ATP-dependent helicase HrpB  39.89 
 
 		 825 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0147  ATP-dependent helicase HrpB  39.24 
 
 		 818 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210088  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0192  ATP-dependent helicase HrpB  42.06 
 
 		 917 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135151 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0359  ATP-dependent helicase HrpB  39.04 
 
 		 872 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4735  ATP-dependent helicase HrpB  37.62 
 
 		 840 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.784057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4808  ATP-dependent helicase HrpB  39.09 
 
 		 844 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0640  ATP-dependent helicase HrpB  42.31 
 
 		 802 aa  459  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163213  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0127  ATP-dependent helicase HrpB  38.71 
 
 		 832 aa  456  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00299316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7166  ATP-dependent helicase HrpB  59.59 
 
 		 885 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236213  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0976  ATP-dependent helicase HrpB  42.78 
 
 		 848 aa  455  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0156609  normal  0.918373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09990  DEAH-box ATP-dependent helicase HrpB  41.43 
 
 		 838 aa  452  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3982  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.64 
 
 		 812 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0579093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0455  ATP-dependent helicase HrpB  39.27 
 
 		 829 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0665  ATP-dependent helicase protein, putative  41.21 
 
 		 832 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3991  ATP-dependent helicase HrpB  38.78 
 
 		 821 aa  446  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4320  ATP-dependent helicase HrpB  39.02 
 
 		 844 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.043486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2470  ATP-dependent helicase HrpB  39.49 
 
 		 844 aa  445  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590615  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0098  ATP-dependent helicase HrpB  40.15 
 
 		 826 aa  445  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.310548 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0648  ATP-dependent helicase HrpB  39.65 
 
 		 842 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242487  normal  0.649022 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1172  ATP-dependent helicase HrpB  39.91 
 
 		 863 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3458  ATP-dependent helicase HrpB  40.07 
 
 		 798 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1588  ATP-dependent helicase HrpB  41.43 
 
 		 847 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.41464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4935  ATP-dependent helicase HrpB  38.88 
 
 		 839 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557516 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0688  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.95 
 
 		 809 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0972793  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4319  ATP-dependent helicase HrpB  38.03 
 
 		 821 aa  439  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2013  DEAD/DEAH box helicase  40.42 
 
 		 808 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1573  thiolase  37.64 
 
 		 864 aa  435  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7107  ATP-dependent helicase HrpB  42.25 
 
 		 850 aa  435  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0067  DEAD box-like helicase  37.39 
 
 		 820 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0419076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4648  ATP-dependent helicase HrpB  39.39 
 
 		 842 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.052727  normal  0.20008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4772  ATP-dependent helicase HrpB  39.5 
 
 		 842 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0178797 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0206  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.68 
 
 		 824 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0217  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.46 
 
 		 824 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.976044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0723  ATP-dependent helicase HrpB  40.2 
 
 		 808 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336305  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0221  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.43 
 
 		 824 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1261  ATP-dependent helicase HrpB  36.33 
 
 		 825 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0343419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0669  ATP-dependent helicase HrpB  38.11 
 
 		 841 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.345787 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3454  ATP-dependent helicase HrpB  36.72 
 
 		 824 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629145  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0704  ATP-dependent helicase HrpB  33.11 
 
 		 869 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2365  ATP-dependent helicase HrpB  43.35 
 
 		 860 aa  422  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.701913  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1306  ATP-dependent helicase HrpB  38.02 
 
 		 900 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.493804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0157  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.08 
 
 		 824 aa  421  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1590  ATP-dependent helicase HrpB  40.11 
 
 		 825 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0205  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.35 
 
 		 824 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.879127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3275  ATP-dependent helicase HrpB  36.75 
 
 		 821 aa  418  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1744  ATP-dependent helicase HrpB  58.59 
 
 		 855 aa  419  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564063  normal  0.839045 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0152  ATP-dependent RNA helicase HrpB  36.86 
 
 		 809 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0559  ATP-dependent helicase HrpB  38 
 
 		 822 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3511  ATP-dependent RNA helicase HrpB  36.97 
 
 		 824 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.661022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0223  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.24 
 
 		 824 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04570  ATP-dependent helicase HrpB  43.41 
 
 		 893 aa  416  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0937803  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2844  ATP-dependent helicase HrpB  39.72 
 
 		 830 aa  419  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.454612  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00147  predicted ATP-dependent helicase  36.75 
 
 		 809 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0534884  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00146  hypothetical protein  36.75 
 
 		 809 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0139  ATP-dependent RNA helicase HrpB  36.75 
 
 		 809 aa  412  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0151  ATP-dependent RNA helicase HrpB  36.64 
 
 		 809 aa  412  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000698462  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3449  ATP-dependent helicase HrpB  39.76 
 
 		 814 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2129  ATP-dependent helicase HrpB  39.53 
 
 		 837 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0501  ATP-dependent helicase HrpB  35.5 
 
 		 833 aa  403  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0632  ATP-dependent helicase HrpB  33.26 
 
 		 835 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1035  ATP-dependent RNA helicase HrpB  36.44 
 
 		 825 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0565  ATP-dependent helicase  34.62 
 
 		 833 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2322  ATP-dependent helicase HrpB  35.55 
 
 		 834 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.334263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0595  ATP-dependent helicase HrpB  41.29 
 
 		 821 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.420753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0554  ATP-dependent helicase HrpB  32.48 
 
 		 848 aa  385  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164012  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0130  ATP-dependent RNA helicase HrpB  34.04 
 
 		 820 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3895  ATP-dependent helicase HrpB  32.44 
 
 		 855 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03270  ATP-dependent RNA helicase  37.57 
 
 		 823 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2972  ATP-dependent helicase HrpB  33.92 
 
 		 838 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0369  ATP-dependent helicase HrpB  35.02 
 
 		 834 aa  359  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0585  ATP-dependent helicase HrpB  31.3 
 
 		 835 aa  357  5.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3165  ATP-dependent helicase HrpB  32.82 
 
 		 850 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3271  ATP-dependent helicase HrpB  30.37 
 
 		 848 aa  350  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4786  ATP-dependent helicase HrpB  37.08 
 
 		 697 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4745  ATP-dependent helicase HrpB, putative  37.5 
 
 		 689 aa  323  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455139  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00470  ATP-dependent helicase HrpB  30.59 
 
 		 894 aa  323  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3081  ATP-dependent helicase HrpB  44.77 
 
 		 827 aa  314  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.895104  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1633  Helicase ATP-dependent domain protein  32.06 
 
 		 861 aa  312  2e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1180  ATP-dependent helicase HrpB  44.56 
 
 		 828 aa  310  9e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9477e-16 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2580  ATP-dependent RNA helicase  47.27 
 
 		 834 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262395  hitchhiker  0.0000513711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1355  ATP-dependent helicase HrpB  36.75 
 
 		 817 aa  308  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.166416  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0536  ATP-dependent helicase HrpB  44.75 
 
 		 825 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>