More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1052 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1052  trigger factor  100 
 
 		 436 aa  881    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  31.97 
 
 		 440 aa  199  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  30.99 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  31.46 
 
 		 435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  28.6 
 
 		 432 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  30.52 
 
 		 429 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  29.3 
 
 		 437 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  28.7 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  32.37 
 
 		 446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  29.4 
 
 		 471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  31.3 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  27.71 
 
 		 474 aa  162  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  30.57 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  31.64 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  27.74 
 
 		 512 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  28.67 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  31.62 
 
 		 513 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  29.44 
 
 		 434 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0186  trigger factor  26.76 
 
 		 444 aa  156  9e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  30.49 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  26.57 
 
 		 428 aa  153  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  28.86 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  28.41 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  28.1 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0224  trigger factor  26.48 
 
 		 444 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  26.86 
 
 		 448 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  30.12 
 
 		 425 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  29.95 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  26.82 
 
 		 436 aa  150  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  29.67 
 
 		 437 aa  149  7e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  29.88 
 
 		 425 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  29.88 
 
 		 425 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  29.88 
 
 		 425 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  29.88 
 
 		 425 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  29.88 
 
 		 425 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  29.88 
 
 		 425 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  28.84 
 
 		 461 aa  149  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  28.16 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  29.88 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  29.88 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  28.19 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  29.85 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  28.24 
 
 		 462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  30 
 
 		 468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  27.21 
 
 		 426 aa  146  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  26.91 
 
 		 443 aa  146  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  28.7 
 
 		 433 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  30.94 
 
 		 481 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  25.58 
 
 		 433 aa  146  8.000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  29.13 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  30.28 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2157  trigger factor  26.97 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  27.89 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  27.11 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  26.14 
 
 		 448 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  28.09 
 
 		 424 aa  145  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  26.19 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  27.77 
 
 		 479 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  26.47 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  27.04 
 
 		 433 aa  143  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  27.04 
 
 		 433 aa  143  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  30.34 
 
 		 463 aa  143  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  29.53 
 
 		 434 aa  143  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  28.44 
 
 		 544 aa  142  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  29.23 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  25 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  25.17 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  28.26 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  28.54 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  25.73 
 
 		 488 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  28.12 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  29.44 
 
 		 452 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1480  trigger factor  26.77 
 
 		 439 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  30.59 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  29.46 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0016  trigger factor  25.39 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  27.04 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  26.79 
 
 		 460 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  27.96 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2849  trigger factor  29.49 
 
 		 454 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0303006 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  27.29 
 
 		 435 aa  136  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  27.98 
 
 		 518 aa  136  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  27.3 
 
 		 439 aa  136  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  25.45 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2391  trigger factor  27.19 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  26.19 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  26.68 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1693  trigger factor  25.85 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  28.42 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  28.42 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  24.55 
 
 		 476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  28.39 
 
 		 440 aa  133  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  28.46 
 
 		 430 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1780  trigger factor  25.34 
 
 		 443 aa  132  9e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  27.21 
 
 		 491 aa  132  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  27.72 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1719  trigger factor  26.37 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  26.51 
 
 		 491 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  26.81 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  26.13 
 
 		 437 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>