268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0190 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0190  peptidase A8 signal peptidase II  100 
 
 
257 aa  527  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.459328  normal  0.539707 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 
173 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 
170 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  30 
 
 
182 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 
168 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  30.13 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 
171 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  32.62 
 
 
168 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  34.04 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  31.16 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  31.88 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 
166 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  31.88 
 
 
173 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  34.09 
 
 
153 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 
170 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  30.06 
 
 
158 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 
167 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  30.2 
 
 
204 aa  63.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  31.18 
 
 
169 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  34.72 
 
 
198 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  33.78 
 
 
164 aa  63.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  31.39 
 
 
163 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  31.91 
 
 
170 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
160 aa  63.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  31.85 
 
 
164 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  28.76 
 
 
179 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
176 aa  63.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  31.91 
 
 
170 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 
166 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 
166 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 
166 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 
166 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 
166 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  32.84 
 
 
170 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  32.84 
 
 
170 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  32.84 
 
 
170 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  32.84 
 
 
170 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  32.84 
 
 
170 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  32.84 
 
 
170 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  32.84 
 
 
170 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 
166 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 
166 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 
170 aa  63.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 
166 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  32.86 
 
 
178 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  31.11 
 
 
170 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  27.67 
 
 
162 aa  62.4  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 
182 aa  62  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  30.11 
 
 
169 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  32.52 
 
 
165 aa  61.6  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  32.8 
 
 
170 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  30.28 
 
 
169 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  28.49 
 
 
195 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  32.59 
 
 
171 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  30.46 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 
170 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  31.61 
 
 
170 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  30.2 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  30.92 
 
 
181 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 
197 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
178 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 
171 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 
357 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  31.69 
 
 
358 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  30.94 
 
 
163 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  30.94 
 
 
163 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  34.85 
 
 
160 aa  60.1  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  30.41 
 
 
166 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  31.37 
 
 
171 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  36.8 
 
 
157 aa  59.3  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  30.26 
 
 
174 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 
176 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  30.26 
 
 
174 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  31.87 
 
 
291 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
169 aa  58.5  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  34.43 
 
 
170 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  29.73 
 
 
166 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  29.73 
 
 
166 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 
171 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 
171 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1577  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 
167 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  29.73 
 
 
166 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  32.45 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  31.06 
 
 
161 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1520  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 
167 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0161435  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 
176 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  30.22 
 
 
145 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  28.95 
 
 
173 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  32.54 
 
 
168 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0481  signal peptidase II  30.2 
 
 
170 aa  57  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  29.05 
 
 
166 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  32.59 
 
 
170 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>