More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6007 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 233 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  83.18 
 
 		 220 aa  364  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  76.74 
 
 		 233 aa  324  7e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  76.74 
 
 		 233 aa  324  7e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  76.74 
 
 		 233 aa  324  7e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  75.69 
 
 		 233 aa  323  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  74.24 
 
 		 244 aa  317  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  73.85 
 
 		 233 aa  316  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  74.77 
 
 		 233 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  74.67 
 
 		 241 aa  309  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  72.4 
 
 		 237 aa  295  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 228 aa  248  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  61.33 
 
 		 232 aa  247  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  61.78 
 
 		 228 aa  247  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  60 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  59.21 
 
 		 238 aa  234  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  60.19 
 
 		 238 aa  234  9e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  57.89 
 
 		 239 aa  231  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  57.69 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  57.69 
 
 		 239 aa  225  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  56.52 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  56.41 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  58.12 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  57.26 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  55.98 
 
 		 239 aa  220  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  56.84 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  60.19 
 
 		 238 aa  220  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  54.78 
 
 		 244 aa  218  7e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  51.95 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  58.45 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  55.56 
 
 		 244 aa  214  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  53.98 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  54.63 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  56.88 
 
 		 238 aa  205  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 237 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  34.01 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  33.76 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 252 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 272 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 272 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 272 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  34.04 
 
 		 264 aa  95.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  34.04 
 
 		 264 aa  95.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 255 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 255 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 255 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 255 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 255 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 255 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  27.49 
 
 		 254 aa  91.7  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  33.94 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  32.71 
 
 		 254 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  31.7 
 
 		 277 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  27.54 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 269 aa  85.5  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 269 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 269 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 243 aa  85.1  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 283 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 269 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 269 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 269 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  33.63 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  31.7 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  33.33 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  32.88 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>